RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	OR7D2	Q96RA2	312 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OR5M11	Q96RB7	305 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	NOX3	Q9HBY0	568 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	GIN1	Q9NXP7	522 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MALT1	Q9UDY8	824 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	BTBD17	A6NE02	478 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CLDN24	A6NM45	220 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF724	A8MTY0	619 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768		A8MXK9	166 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PDLIM1	O00151	329 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	BMPR1B	O00238	502 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	HMGN4	O00479	90 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	FCMR	O60667	390 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CYTIP	O60759	359 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	RAMP3	O60896	148 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ANGPTL1	O95841	491 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CH25H	O95992	272 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SBK2	P0C263	348 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	RYK	P34925	604 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SOAT1	P35610	550 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	KIR2DS4	P43632	304 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PAX2	Q02962	417 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	NPRL3	Q12980	569 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	DECR1	Q16698	335 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TIGD6	Q17RP2	521 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	KLHL26	Q53HC5	615 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ESCO2	Q56NI9	601 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	DCST2	Q5T1A1	773 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ATG16L1	Q676U5	607 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	C11orf88	Q6PI97	169 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CASP12	Q6UXS9	341 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	COX18	Q8N8Q8	333 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SNAPC3	Q92966	411 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	NEURL3	Q96EH8	262 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ARL5B	Q96KC2	179 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	C18orf15	Q96N68	181 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	STAC	Q99469	402 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SDF2	Q99470	211 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	DPY30	Q9C005	99 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OR51I1	Q9H343	314 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PIGU	Q9H490	435 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768		A0A0B4J293	547 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1W2PQD3	144 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TTC36	A6NLP5	189 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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