RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613241.1

EP400NL-213, Transcript of EP400 N-terminal-like protein, human

TSL 3

Gene EP400NL, Length 455 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP400NL-213	ENST00000613241	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EP400NL-213	ENST00000613241	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EP400NL-213	ENST00000613241	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EP400NL-213	ENST00000613241		A0A1W2PRQ8	180 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	CXCR6	O00574	342 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	FAM20B	O75063	409 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	SFTPB	P07988	381 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	MELTF	P08582	738 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	ACSM4	P0C7M7	580 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	MMP9	P14780	707 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	CFHR2	P36980	270 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	CD200	P41217	278 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	KRTAP10-3	P60369	221 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	LIPE	Q05469	1076 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	DGCR6	Q14129	220 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	GPR157	Q5UAW9	335 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	RRM2B	Q7LG56	351 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	TMEM86B	Q8N661	226 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	TBX15	Q96SF7	602 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	BEX1	Q9HBH7	125 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	NME4	O00746	187 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	CCDC22	O60826	627 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	PPP1R3D	O95685	299 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	SERPINA1	P01009	418 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	IRF2	P14316	349 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	SEC23B	Q15437	767 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	MPPED2	Q15777	294 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	OR6V1	Q8N148	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	ERGIC1	Q969X5	290 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	FUZ	Q9BT04	418 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	ARMCX1	Q9P291	453 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	B9D1	Q9UPM9	204 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241		A0A0G2JK05	382 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	ZNF879	B4DU55	563 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	P2RY10	O00398	339 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	CRYBA1	P05813	215 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	CRABP1	P29762	137 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	CENPA	P49450	140 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	NPY4R	P50391	375 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	RPS6KA3	P51812	740 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	SLC7A2	P52569	658 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	FGD3	Q5JSP0	725 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	BRICD5	Q6PL45	260 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	NAA40	Q86UY6	237 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	TECTB	Q96PL2	329 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	UNC119B	A6NIH7	251 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241		F5H5K5	113 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	GSTA4	O15217	222 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	SLC22A2	O15244	555 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	FCN3	O75636	299 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	ANOS1	P23352	680 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	GGT2	P36268	569 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	GSK3B	P49841	420 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EP400NL-213	ENST00000613241	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		10.61	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms