RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 NR0B2Q15466 257 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CTF1Q16619 201 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 DRAM2Q6UX65 266 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 HCRTO43612 131 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 WDR1O75083 606 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ASIC5Q9NY37 505 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FRS3O43559 492 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 DRD1P21728 446 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 METAP1P53582 386 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 VRK2Q86Y07 508 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR6C76A6NM76 312 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF716A6NP11 495 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 J3KTA2 159 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SSSCA1O60232 199 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FZD6O60353 706 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SEMA7AO75326 666 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 POU2F2P09086 479 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 NPY4RP50391 375 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SCAND1P57086 179 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GBF1Q92538 1859 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SCN7AQ01118 1682 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 DLX1P56177 255 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FOXK2Q01167 660 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PELI3Q8N2H9 469 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC15Q8TF66 581 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TAAR9Q96RI9 348 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ISLRO14498 428 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 SFTPCP11686 197 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GALR1P47211 349 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ETFDHQ16134 617 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CLLU1Q5K131 121 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 NTNG2Q96CW9 530 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 IL17CQ9P0M4 197 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 NME2P1O60361 137 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GDF1P27539 372 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OTX2P32243 289 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 KCNJ10P78508 379 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 FAM3AP98173 230 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SYT14P1Q58G82 188 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF787Q6DD87 383 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 MAP6Q96JE9 813 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR52A4PA6NMU1 304 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GPR31O00270 319 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GJB5O95377 273 aa6.38□□□□□ -1.39
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PTPRT-209ENST00000612229 ASCL1P50553 236 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 IGFBP7Q16270 282 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 IGSF21Q96ID5 467 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 STARD5Q9NSY2 213 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GTQ1 180 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 RGS13O14921 159 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 GPR75O95800 540 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-209ENST00000612229 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.38□□□□□ -1.39
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