RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598038.5

GTPBP3-216, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 5

Gene GTPBP3, Length 2,917 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-216	ENST00000598038	HIST1H2AB	P04908	130 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	HCCS	P53701	268 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	TSPAN31	Q12999	210 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR7A5	Q15622	319 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	RAET1L	Q5VY80	246 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	GALNT16	Q8N428	558 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	MED9	Q9NWA0	146 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	CLN5	O75503	358 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	ACTL6A	O96019	429 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	DAO	P14920	347 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	PCP4	P48539	62 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR2B8P	P59922	312 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR4K13	Q8NH42	304 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	TSSK2	Q96PF2	358 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	OPN4	Q9UHM6	478 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GTPBP3-216	ENST00000598038	GPANK1	O95872	356 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	PGC	P20142	388 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	TMEM99	Q8N816	258 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	CHST6	Q9GZX3	395 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	TMEM129	A0AVI4	362 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	TMEM218	A2RU14	115 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	CCS	O14618	274 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	DPM1	O60762	260 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	HLA-DOB	P13765	273 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	SSX2	Q16385	188 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	OCLN	Q16625	522 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	OPN5	Q6U736	354 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	SEC22A	Q96IW7	307 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	UBQLN3	Q9H347	655 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	DOCK7	Q96N67	2140 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	PRODH	O43272	600 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	CNR1	P21554	472 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	CYB561	P49447	251 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	POU4F2	Q12837	409 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	FHL1	Q13642	323 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	C3AR1	Q16581	482 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	POC1B	Q8TC44	478 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	C14orf79	Q96F83	325 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR2M5	A3KFT3	312 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	TP53I11	O14683	189 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	KLF4	O43474	513 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	RAMP1	O60894	148 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	S100A8	P05109	93 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	EPX	P11678	715 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR1C1	Q15619	314 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	SVBP	Q8N300	66 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR2M3	Q8NG83	312 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ITGB2	P05107	769 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	FBP1	P09467	338 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	TMEM17	Q86X19	198 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	CDK20	Q8IZL9	346 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038	PRO1933	Q9H354	126 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038		A0A0G2JK05	382 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP3-216	ENST00000598038		J3QLW9	94 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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