RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 OR3A2P47893 321 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 LSSP48449 732 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 AKR1D1P51857 326 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 EMP2P54851 167 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SRPXP78539 464 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF117Q03924 483 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PLA2G7Q13093 441 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CD226Q15762 336 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 DNLZQ5SXM8 178 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 THEM4Q5T1C6 240 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR157Q5UAW9 335 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CHST4Q8NCG5 386 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 OR8K3Q8NH51 312 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ST7LQ8TDW4 575 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB3CQ96E17 227 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF75AQ96N20 296 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MICU1Q9BPX6 476 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 RHOFQ9HBH0 211 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR27Q9NS67 375 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CUTCQ9NTM9 273 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-202ENST00000586851 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.9□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PQF6 199 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 WRBO00258 174 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR31O00270 319 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2CO00762 179 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 MBTPS2O43462 519 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 CLPSP04118 112 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM157CP0CG43 387 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 GLULP15104 373 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 PVRP15151 417 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 CTLA4P16410 223 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF28P17035 718 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 AKR1C4P17516 323 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 GLP1RP43220 463 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF84P51523 738 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 UCP2P55851 309 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 HSD11B2P80365 405 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 HTRA3P83110 453 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 RSU1Q15404 277 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNMB1Q16558 191 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM240Q5SV17 173 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 STPG1Q5TH74 334 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 OR10K2Q6IF99 312 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 Q6ZSR6 202 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 DOK3Q7L591 496 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 GKN2Q86XP6 184 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 KMT5CQ86Y97 462 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 C1QL4Q86Z23 238 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 ASB10Q8WXI3 467 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms