RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 CDC14BO60729 498 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 APOC1P02654 83 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 H2BFMP0C1H6 154 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ACSM4P0C7M7 580 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 LYNX1P0DP58 116 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 RAC2P15153 192 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 SELEP16581 610 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 PSG7Q13046 419 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 TEX30Q5JUR7 227 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 PGAP1Q75T13 922 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 RDH5Q92781 318 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 EME1Q96AY2 570 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 DIRC2Q96SL1 478 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 KCNJ15Q99712 375 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ABHD6Q9BV23 337 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 POFUT1Q9H488 388 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 SP140LQ9H930 580 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 MSL2Q9HCI7 577 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 CR1P17927 2039 aa6.64□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 GGT3PA6NGU5 568 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZAR1LA6NP61 321 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 M0R129 80 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 PRKYO43930 277 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 NCR1O76036 304 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 HPXP02790 462 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 LYNP07948 512 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 SLC2A1P11166 492 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ACHEP22303 614 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 COL8A2P25067 703 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 EPHA2P29317 976 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ATP6V1E1P36543 226 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 NR4A2P43354 598 aa6.63□□□□□ -1.35
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SMG6-211ENST00000572369 CX3CR1P49238 355 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 CDC42P60953 191 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZSCAN26Q16670 478 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 HFEQ30201 348 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 FAM209AQ5JX71 171 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 OR2T2Q6IF00 324 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 DRAM2Q6UX65 266 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 USP51Q70EK9 711 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 KRT77Q7Z794 578 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 NAA40Q86UY6 237 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 TIGD4Q8IY51 512 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZNF786Q8N393 782 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 TMEM163Q8TC26 289 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 HAVCR1Q96D42 359 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 TEAD3Q99594 435 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 TOR3AQ9H497 397 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 MARCH7Q9H992 704 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 CHODLQ9H9P2 273 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 BRD7Q9NPI1 651 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.62□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.62□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 XRCC2O43543 280 aa6.62□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 IGHV1-46P01743 117 aa6.62□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 PSKH1P11801 424 aa6.62□□□□□ -1.35
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