RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	DHRS12	A0PJE2	317 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200		H0YL77	283 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	CLU	P10909	449 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	MMP16	P51512	607 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TPTE	P56180	551 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS12	P56730	875 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX30	Q5JUR7	227 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF511	Q8NB15	262 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	GIPC3	Q8TF64	312 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	CMC2	Q9NRP2	79 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		18.33	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0G2JMP0	313 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0X1KG70	313 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM178B	H3BS89	294 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200		M0R135	149 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	LCAT	P04180	440 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	SBK2	P0C263	348 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	SELE	P16581	610 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	BTG1	P62324	171 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	ZMYND11	Q15326	602 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	SPTSSA	Q969W0	71 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF799	Q96GE5	643 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	METRN	Q9UJH8	293 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	FMO3	P31513	532 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	ENTPD1	P49961	510 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	ST7L	Q8TDW4	575 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM100	Q9NV29	134 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	C5orf63	A6NC05	138 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200		F5H5P2	479 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200		J3QLI3	93 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNL4	K9M1U5	179 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	GYG2	O15488	501 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	TCF21	O43680	179 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNG	P01579	166 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	MALL	Q13021	153 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	LIPN	Q5VXI9	398 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	DRAM2	Q6UX65	266 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	SPIC	Q8N5J4	248 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	PPIAL4D	F5H284	164 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-DPB1	P04440	258 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	SPARC	P09486	303 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF3	P17036	446 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	GATA3	P23771	443 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	GRK5	P34947	590 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	GATA4	P43694	442 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	BLVRA	P53004	296 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	LCN2	P80188	198 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	FLOT2	Q14254	428 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	PGAP1	Q75T13	922 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	OPN4	Q9UHM6	478 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM183A	A6NL82	134 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	PMEL	P40967	661 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC6A9	P48067	706 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF92	Q03936	586 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	MAB21L1	Q13394	359 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52

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