RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 CPNE9Q8IYJ1 553 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 CBR4Q8N4T8 237 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 ACBD7Q8N6N7 88 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 ACVR1CQ8NER5 493 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 NOXO1Q8NFA2 376 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 OR4D5Q8NGN0 318 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 OR6N1Q8NGY5 312 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 OR5J2Q8NH18 312 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 LYPD6BQ8NI32 183 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SPPL2BQ8TCT7 592 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 HPSE2Q8WWQ2 592 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 RPEQ96AT9 228 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC126Q96EE4 140 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 PELI1Q96FA3 418 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 PYURFQ96I23 114 aa4.88□□□□□ -1.63
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CAPN3-211ENST00000562199 GPR137Q96N19 417 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF347Q96SE7 839 aa4.88□□□□□ -1.63
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CAPN3-211ENST00000562199 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SLC39A8Q9C0K1 460 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 TXNIPQ9H3M7 391 aa4.88□□□□□ -1.63
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CAPN3-211ENST00000562199 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 LHX9Q9NQ69 397 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 INPP5EQ9NRR6 644 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 CLN6Q9NWW5 311 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 WDR45Q9Y484 360 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 HES2Q9Y543 173 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 WDR90Q96KV7 1748 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1W2PRF3 423 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1W2PRM7 423 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 CXorf65A6NEN9 183 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 A8MWP6 167 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF878C9JN71 531 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 MS4A18H0YCH9 400 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 C15orf65H3BRN8 121 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 J3QLI3 93 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 K7EN84 100 aa4.87□□□□□ -1.63
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CAPN3-211ENST00000562199 FAAHO00519 579 aa4.87□□□□□ -1.63
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CAPN3-211ENST00000562199 SLC25A27O95847 323 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 IGHG3P01860 377 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 CD74P04233 296 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 SERPINA7P05543 415 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 KLK1P06870 262 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 RHOCP08134 193 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 CSF3P09919 207 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 CT62P0C5K7 136 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 DANCRP0C864 163 aa4.87□□□□□ -1.63
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CAPN3-211ENST00000562199 HOXB2P14652 356 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 KITLGP21583 273 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 FASP25445 335 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 ITPKBP27987 946 aa4.87□□□□□ -1.63
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CAPN3-211ENST00000562199 GABARAPL2P60520 117 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 CTXN1P60606 82 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 OSTNP61366 133 aa4.87□□□□□ -1.63
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CAPN3-211ENST00000562199 TRAF3Q13114 568 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 OR1Q1Q15612 314 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 ISXQ2M1V0 245 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 GGTA1PQ4G0N0 100 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 CARD16Q5EG05 197 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 AVPI1Q5T686 147 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 FAM78BQ5VT40 261 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM268Q5VZI3 342 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 RGMBQ6NW40 437 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 CYP2R1Q6VVX0 501 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
CAPN3-211ENST00000562199 TMPPEQ6ZT21 453 aa4.87□□□□□ -1.63
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