RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	PSG4	Q00888	419 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	FAM27E3	Q08E93	113 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	TAF13	Q15543	124 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	TRAM1	Q15629	374 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF773	Q6PK81	442 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	AHSA2	Q719I0	299 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	LRRC18	Q8N456	261 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	WDR31	Q8NA23	367 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	FAM222B	Q8WU58	562 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	S100PBP	Q96BU1	408 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	MAP6	Q96JE9	813 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF75A	Q96N20	296 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	OR8B4	Q96RC9	309 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	DOK1	Q99704	481 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	MED18	Q9BUE0	208 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ABHD6	Q9BV23	337 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ALG8	Q9BVK2	526 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	RNF121	Q9H920	327 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965		A0A0U1RQV5	110 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	TVP23A	A6NH52	213 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	CASK	O14936	926 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	RER1	O15258	196 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	XRCC2	O43543	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	GPRIN2	O60269	458 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	CRYAA	P02489	173 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ISG15	P05161	165 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	CD79A	P11912	226 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ATP6V1B1	P15313	513 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	GAL	P22466	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	CRYGS	P22914	178 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	HTR5A	P47898	357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	GALK2	Q01415	458 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF85	Q03923	595 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	IRF3	Q14653	427 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	TAB1	Q15750	504 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	MEP1B	Q16820	701 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	MDP1	Q86V88	176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	THEM6	Q8WUY1	208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	C10orf35	Q96D05	121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF649	Q9BS31	505 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHP1-208	ENST00000560965	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61

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