RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560185.1

AKAP13-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 2

Gene AKAP13, Length 611 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-215	ENST00000560185	PHYH	O14832	338 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	TBX1	O43435	398 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	MAGEB1	P43366	347 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	CX3CR1	P49238	355 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	TMEM33	P57088	247 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	POU4F2	Q12837	409 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	OR2T2	Q6IF00	324 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	USP51	Q70EK9	711 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	NIPAL2	Q9H841	368 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	MSL2	Q9HCI7	577 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	C8orf4	Q9NR00	106 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	DLL4	Q9NR61	685 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	TMEM100	Q9NV29	134 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	GGT3P	A6NGU5	568 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185		M0R129	80 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	MPZL2	O60487	215 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	IGHV1-46	P01743	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	HPX	P02790	462 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ANPEP	P15144	967 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ALOX5AP	P20292	161 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ACHE	P22303	614 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	TMED1	Q13445	227 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	RCN1	Q15293	331 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	TRIP10	Q15642	601 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	HFE	Q30201	348 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	OR5AS1	Q8N127	324 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	OR8G5	Q8NG78	346 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185		Q96MT0	163 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC29A1	Q99808	456 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	OR10A2	Q9H208	303 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	POFUT1	Q9H488	388 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	OPA3	Q9H6K4	179 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	CHODL	Q9H9P2	273 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	BRD7	Q9NPI1	651 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	XRCC2	O43543	280 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	PSKH1	P11801	424 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	TNFRSF1A	P19438	455 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	COL8A2	P25067	703 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	HTR1F	P30939	366 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	OPRL1	P41146	370 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	NR4A2	P43354	598 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	HCCS	P53701	268 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	CDK5R2	Q13319	367 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	GGTLC2	Q14390	218 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	TIGD6	Q17RP2	521 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	CCDC182	A6NF36	153 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	CDC14B	O60729	498 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF254	O75437	659 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	LYNX1	P0DP58	116 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC2A1	P11166	492 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	CRYBB2	P43320	205 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC3A1	Q07837	685 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	CCL17	Q92583	94 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	TIMD4	Q96H15	378 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	RDH12	Q96NR8	316 aa		13.57	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms