RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559154.5

PSMA4-211, Transcript of proteasome subunit alpha 4, human

TSL 2

Gene PSMA4, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA4-211	ENST00000559154	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	FAM110B	Q8TC76	370 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	SFXN5	Q8TD22	340 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	ABHD3	Q8WU67	409 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	OSTF1	Q92882	214 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	C1orf50	Q9BV19	199 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	PIGU	Q9H490	435 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	FREM3	P0C091	2139 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	MED12	Q93074	2177 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	TRIM64B	A6NI03	449 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	CLOCK	O15516	846 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	SPAG7	O75391	227 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	LY6G6D	O95868	133 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	C6orf47	O95873	294 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	AK1	P00568	194 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	FGF4	P08620	206 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	LAMP1	P11279	417 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	BCL3	P20749	454 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	PRPS1L1	P21108	318 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	CPT2	P23786	658 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	PPP5C	P53041	499 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	ATP5J2	P56134	94 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	HPCA	P84074	193 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	QPRT	Q15274	297 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	XKR7	Q5GH72	579 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	CBLN3	Q6UW01	205 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	FCRLA	Q7L513	359 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	OR5W2	Q8NH69	310 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	S100PBP	Q96BU1	408 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	OR7D2	Q96RA2	312 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	ABCA4	P78363	2273 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154		A0A1W2PP18	115 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	ZNF264	O43296	627 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	BPGM	P07738	259 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	YES1	P07947	543 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	NUDT17	P0C025	328 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	IRF2	P14316	349 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	PGC	P20142	388 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	ACHE	P22303	614 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	KHK	P50053	298 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	XG	P55808	180 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	TAB1	Q15750	504 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	STK11	Q15831	433 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSMA4-211	ENST00000559154	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75

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