RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-204ENST00000558065 SDSLQ96GA7 329 aa9.9□□□□□ -0.82
SEMA4B-204ENST00000558065 ATP6V0BQ99437 205 aa9.9□□□□□ -0.82
SEMA4B-204ENST00000558065 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa9.9□□□□□ -0.82
SEMA4B-204ENST00000558065 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.9□□□□□ -0.82
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF860A6NHJ4 632 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 LDB2O43679 373 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 NID1P14543 1247 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 EPCAMP16422 314 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 S100A10P60903 97 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 NR0B2Q15466 257 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 FCRLAQ7L513 359 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 DYRK2Q92630 601 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM186Q96B77 213 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 KLK14Q9P0G3 267 aa9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 NME2P1O60361 137 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 CTSLP07711 333 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 HOXC6P09630 235 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM225BP0DP42 221 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 MRGPRGQ86SM5 289 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 MRGPREQ86SM8 312 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 SIRT6Q8N6T7 355 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 OR5W2Q8NH69 310 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 SEH1LQ96EE3 360 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 TAF9BQ9HBM6 251 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 NME7Q9Y5B8 376 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 MCM3APO60318 1980 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 B9A039 149 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 FGF17O60258 216 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 SAP30O75446 220 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF286BP0CG31 522 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 CDK2P24941 298 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 CCL23P55773 120 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 GAS6Q14393 721 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 SNAI3Q3KNW1 292 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 ACSM3Q53FZ2 586 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 RAB41Q5JT25 222 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 LEG1Q6P5S2 330 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 GFI1Q99684 422 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 GPA33Q99795 319 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 RNF208Q9H0X6 261 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 MTFP1Q9UDX5 166 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A1B0GU03 582 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 OR4C45A6NMZ5 311 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC16A5O15375 505 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 GNG7O60262 68 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 F11P03951 625 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 RAB38P57729 211 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 TAS2R20P59543 309 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC35A1P78382 337 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 ARF5P84085 180 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 IL24Q13007 206 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 GPNMBQ14956 572 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 ADIPOR1Q96A54 375 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 CLN8Q9UBY8 286 aa9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A1W2PPK0 400 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 C8AP07357 584 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 IL3P08700 152 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 SCGB1A1P11684 91 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 MMP11P24347 488 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 ARL2P36404 184 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 PMP22Q01453 160 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.836e-10■■■■■ 29
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC25A52Q3SY17 297 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 OR4A47Q6IF82 309 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 UBALD2Q8IYN6 164 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 UPB1Q9UBR1 384 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 IGLON5A6NGN9 336 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 HSD17B6O14756 317 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 PF4V1P10720 104 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 RND2P52198 227 aa9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 RANP62826 216 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF763Q0D2J5 394 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.8 ms