RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558040.5

SNX1-203, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNX1, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-203ENST00000558040 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 SSR3Q9UNL2 185 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 CACNA1CQ13936 2221 aa14.66□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 ESPL1Q14674 2120 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 AGFG2O95081 481 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 GABARAPO95166 117 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 SLC2A1P11166 492 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 CCNOP22674 350 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 TAB1Q15750 504 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 TMEM244Q5VVB8 128 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 THRSPQ92748 146 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 OR10A2Q9H208 303 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 CDH20Q9HBT6 801 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 MYO7BQ6PIF6 2116 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX1-203ENST00000558040 TBX1O43435 398 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 IGLV1-44P01699 117 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 TTRP02766 147 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 LCATP04180 440 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ISG15P05161 165 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ACHEP22303 614 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 GPR148Q8TDV2 347 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ISOC1Q96CN7 298 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 OR51E2Q9H255 320 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 A0A0U1RQV5 110 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 A0A1B0GVI7 797 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 J3QW42 95 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CLDN14O95500 239 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CELA3BP08861 270 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CRYBB2P43320 205 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 SORDQ00796 357 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 FABP5Q01469 135 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ODF4Q2M2E3 257 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 NAA40Q86UY6 237 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 COMMD2Q86X83 199 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ABHD4Q8TB40 342 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.63□□□□□ -0.07
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SNX1-203ENST00000558040 RGCCQ9H4X1 137 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 HHLA2Q9UM44 414 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 IGSF10Q6WRI0 2623 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 GABRPO00591 440 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 XRCC2O43543 280 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ZG16O60844 167 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 GPX5O75715 221 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CECR9P0C854 216 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CCL2P13500 99 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ZNF12P17014 697 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ZNF83P51522 516 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 HGFACQ04756 655 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 PHYHIPQ92561 330 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 MED18Q9BUE0 208 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 NGBQ9NPG2 151 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ZNF879B4DU55 563 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 M0R1B8 84 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 P2RY10O00398 339 aa14.61□□□□□ -0.07
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