RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SLC22A4Q9H015 551 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 WDR76Q9H967 626 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 CLN8Q9UBY8 286 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GUS0 222 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GWJ7 208 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 DCTN6O00399 190 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 PHYHO14832 338 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ARPC3O15145 178 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 MLNRO43193 412 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 IDH3BO43837 385 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 GMDSO60547 372 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 DIRAS1O95057 198 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 GADD45GO95257 159 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 PPP1R3DO95685 299 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 PLATP00750 562 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 HLA-DQA2P01906 255 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 LCATP04180 440 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 LIPFP07098 398 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ACSM4P0C7M7 580 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SLC6A6P31641 620 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 IFNGR2P38484 337 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 GATA4P43694 442 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 NPY4RP50391 375 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 RAD23AP54725 363 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 TPTEP56180 551 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 FXYD6P3P58550 94 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 PSME3P61289 254 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 MAB21L1Q13394 359 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 KCNJ8Q15842 424 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 GPR157Q5UAW9 335 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 CD276Q5ZPR3 534 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 TREML4Q6UXN2 200 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 OR4K13Q8NH42 304 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 Q8TCH9 128 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SPTSSAQ969W0 71 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 IFT27Q9BW83 186 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SLITRK2Q9H156 845 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 NOX4Q9NPH5 578 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ADA2Q9NZK5 511 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.81□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 KCNAB3O43448 404 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 NDUFA2O43678 99 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 OR10H3O60404 316 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ZNF823P16415 610 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 GGT2P36268 569 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 CD200P41217 278 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 FGF12P61328 243 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ANK2Q01484 3957 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 OR8G1Q15617 311 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 FAM201AQ5SY85 155 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SPATC1Q76KD6 591 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 NAA40Q86UY6 237 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 FITM2Q8N6M3 262 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 FANK1Q8TC84 345 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 PYURFQ96I23 114 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.8□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 FUZQ9BT04 418 aa6.8□□□□□ -1.32
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