RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067		X6R8D5	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CIB4	A0PJX0	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TRIM64B	A6NI03	449 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RER1	O15258	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RGS5	O15539	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	DOK2	O60496	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZFPL1	O95159	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TGM6	O95932	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RAF1	P04049	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	B4GALT1	P15291	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF20	P17024	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ACHE	P22303	614 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PCSK6	P29122	969 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MPG	P29372	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	AGTR1	P30556	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SDC2	P34741	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PEX19	P40855	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OPRL1	P41146	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR3A2	P47893	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SLC6A9	P48067	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CX3CR1	P49238	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PRKX	P51817	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	GALK2	Q01415	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TESK1	Q15569	626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MOG	Q16653	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OTP	Q5XKR4	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	AMELY	Q99218	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	HHLA2	Q9UM44	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067		A0A075B6Q4	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR6C6	A6NF89	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067		F5H5K5	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067		K7EM74	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MAGEB3	O15480	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SYT7	O43581	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM127	O75204	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	UBL3	O95164	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ABHD16A	O95870	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	UCHL1	P09936	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CD79A	P11912	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF32	P17041	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SRM	P19623	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RAB3B	P20337	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	APLNR	P35414	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TALDO1	P37837	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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