RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 ELFN2Q5R3F8 820 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 FAHD1Q6P587 224 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 CFAP77Q6ZQR2 320 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 DNM1P46Q6ZS02 220 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 OR6K6Q8NGW6 343 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SLC25A40Q8TBP6 338 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 PITX2Q99697 317 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 WDR76Q9H967 626 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 CMC2Q9NRP2 79 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 TMEM160Q9NX00 188 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 PLCE1Q9P212 2302 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 OR6C6A6NF89 314 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 F5H5K5 113 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 LYNX1G3V0Z9 82 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 M0R233 179 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ABHD16AO95870 558 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 HMGN1P05114 100 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 LYNX1P0DP58 116 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 PF4V1P10720 104 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 PSKH1P11801 424 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 FCGR1AP12314 374 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ZNF250P15622 560 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 GCH1P30793 250 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 FMO3P31513 532 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 MPV17P39210 176 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 EVX1P49640 407 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 PPOXP50336 477 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SLC25A1P53007 311 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 PPP1CBP62140 327 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 HIST1H3AP68431 136 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 LIPNQ5VXI9 398 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 PLBD1Q6P4A8 553 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ARL9Q6T311 187 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 NAA40Q86UY6 237 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 CPOQ8IVL8 374 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 MAP6Q96JE9 813 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 PKP2Q99959 881 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 POFUT1Q9H488 388 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 CHODLQ9H9P2 273 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 KRT84Q9NSB2 600 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 STARD10Q9Y365 291 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 A0A096LNT2 108 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 H3BNX3 289 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 SURF4O15260 269 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 SPARCP09486 303 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PAICSP22234 425 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 IGFBP5P24593 272 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 EPHA2P29317 976 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 SNAPC1Q16533 368 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 KLHL12Q53G59 568 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 TMEM255AQ5JRV8 349 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 FAM168AQ92567 244 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 CENPMQ9NSP4 180 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 OAZ3Q9UMX2 235 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 DBX1A6NMT0 343 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 LMX1BO60663 402 aa8.2□□□□□ -1.1
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