RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 TAF13Q15543 124 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ODF4Q2M2E3 257 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 LIPKQ5VXJ0 399 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 FDX2Q6P4F2 183 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ARL9Q6T311 187 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 FAM57BQ71RH2 274 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 SATL1Q86VE3 508 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 P2RY8Q86VZ1 359 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 PHC2Q8IXK0 858 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 RDH10Q8IZV5 341 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ZNF283Q8N7M2 679 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 SLC30A7Q8NEW0 376 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 OR13F1Q8NGS4 319 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 OR10AC1Q8NH08 325 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 YIPF6Q96EC8 236 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 OR10A4Q9H209 315 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 OR51B6Q9H340 312 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 POFUT1Q9H488 388 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 DNHD1Q96M86 4753 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ZFHX3Q15911 3703 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 CENPEQ02224 2701 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 CACNA1DQ01668 2161 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 DPRXA6NFQ7 191 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 M0R1B8 84 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 LMX1BO60663 402 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 TACSTD2P09758 323 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 EPXP11678 715 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ZNF35P13682 527 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 IGFBP2P18065 325 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 CELP19835 753 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 CCNOP22674 350 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 DCTDP32321 178 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 MAGEB1P43366 347 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 SLC6A9P48067 706 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 NR1H2P55055 460 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ERVS71-1P61550 626 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 SORDQ00796 357 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 NAAAQ02083 359 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 BDH1Q02338 343 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 PLP2Q04941 152 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 SLC3A1Q07837 685 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 TPBGQ13641 420 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 DRAM2Q6UX65 266 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 SPTSSAQ969W0 71 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 MUCL1Q96DR8 90 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 SMIM19Q96E16 107 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 LYZL4Q96KX0 146 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 MED18Q9BUE0 208 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 NIPAL2Q9H841 368 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 OR52A1Q9UKL2 312 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 CADP27708 2225 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 A0A1B0GTI1 187 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 P2RY10O00398 339 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 PLPP2O43688 288 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 SMPD2O60906 423 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 IGLV3-1P01715 115 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 LCATP04180 440 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 FAM157BP0CG42 384 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 PPP3CBP16298 524 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-216ENST00000549221 NR4A1P22736 598 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms