RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543002.5

RABGGTA-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 1,329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-203ENST00000543002 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 LRP12Q9Y561 859 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 A0A1W2PPW3 197 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 J3QRE1 110 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 SLC2A1P11166 492 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 DCTDP32321 178 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 VHLP40337 213 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 PTH2RP49190 550 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 PPOXP50336 477 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 EGR3Q06889 387 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 MOGQ16653 247 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 LGALS12Q96DT0 336 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 TBX5Q99593 518 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 SP140LQ9H930 580 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 AMBNQ9NP70 447 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 TAAR3PQ9P1P4 343 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 TEX15Q9BXT5 2789 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 M0R233 179 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 PSMD9O00233 223 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 RAC2P15153 192 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 HSPA13P48723 471 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 ACTC1P68032 377 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 ACTA1P68133 377 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 MALLQ13021 153 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 PSG7Q13046 419 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 CDK5R2Q13319 367 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 SSX6Q7RTT6 188 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 FBLIM1Q8WUP2 373 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 HAVCR1Q96D42 359 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 CMBLQ96DG6 245 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 PERPQ96FX8 193 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 GPR160Q9UJ42 338 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTA-203ENST00000543002 ARID1AO14497 2285 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 C5orf63A6NC05 138 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 ADRA2AP08913 450 aa14.64□□□□□ -0.07
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RABGGTA-203ENST00000543002 ALDH3B1P43353 468 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 ART1P52961 327 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 ATP5J2P56134 94 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 RAB40BQ12829 278 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 NDUFS7O75251 213 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF85Q03923 595 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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RABGGTA-203ENST00000543002 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 FAM57BQ71RH2 274 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 ACBD7Q8N6N7 88 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 SNX33Q8WV41 574 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 BRD7Q9NPI1 651 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 DAPL1A0PJW8 107 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 ACOD1A6NK06 481 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 TBX1O43435 398 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 XRCC2O43543 280 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 SULT1C4O75897 302 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 IGHV4-39P01824 125 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 IGHA1P01876 353 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 MT-ND5P03915 603 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 LIPAP38571 399 aa14.62□□□□□ -0.07
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