RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540719.1

QKI-211, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, humanhuman

TSL 2

Gene QKI, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QKI-211ENST00000540719 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 LEG1Q6P5S2 330 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 FITM2Q8N6M3 262 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 RNF148Q8N7C7 305 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 ERGIC1Q969X5 290 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 ATF6BQ99941 703 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 RERGLQ9H628 205 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 IL1RAPQ9NPH3 570 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 MED4Q9NPJ6 270 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 MIOXQ9UGB7 285 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 AURKCQ9UQB9 309 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7.33□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 C22orf46C9J442 243 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 HLA-DPB1P04440 258 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 MMP9P14780 707 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 SLC6A6P31641 620 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 MAGEA2P43356 314 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 PRSS12P56730 875 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 SMIM11AP58511 58 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 ECH1Q13011 328 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 MPPED2Q15777 294 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 DNM1P34Q6PK57 102 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 PARP8Q8N3A8 854 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 OR4C15Q8NGM1 316 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 OR4K13Q8NH42 304 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 FANK1Q8TC84 345 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 DUX5Q96PT3 197 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 MRI1Q9BV20 369 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 TMEM100Q9NV29 134 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 IL20Q9NYY1 176 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 CTSZQ9UBR2 303 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.32□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 F5H5K5 113 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 PHYHO14832 338 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 ARPC2O15144 300 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 KCNAB3O43448 404 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 FAM20BO75063 409 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 RENP00797 406 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 LHBP01229 141 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 RRM2P31350 389 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 GNB2P62879 340 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 ZNF92Q03936 586 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 BAMBIQ13145 260 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 SLC36A3Q495N2 470 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 TEX30Q5JUR7 227 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 PGAM4Q8N0Y7 254 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 SPSB4Q96A44 273 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 SLCO4A1Q96BD0 722 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 PITX2Q99697 317 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 IFT27Q9BW83 186 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 HCAR1Q9BXC0 346 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 SLITRK2Q9H156 845 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 FN3KQ9H479 309 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 ADA2Q9NZK5 511 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.31□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.3□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.3□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 POM121CA8CG34 1229 aa7.3□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 CD300LBA8K4G0 201 aa7.3□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 M0R135 149 aa7.3□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 OR10H3O60404 316 aa7.3□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 GMDSO60547 372 aa7.3□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 GASTP01350 101 aa7.3□□□□□ -1.24
QKI-211ENST00000540719 FABP3P05413 133 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms