RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 OR52I2Q8NH67 350 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 GPR87Q9BY21 358 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 PRODH2Q9UF12 536 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 IL19Q9UHD0 177 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 ARF6P62330 175 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 AUNIPQ9H7T9 357 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 OR52A1Q9UKL2 312 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 DECR1Q16698 335 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 POM121L1PQ3SYA9 428 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 MS4A10Q96PG2 267 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 OR51B6Q9H340 312 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 CHODLQ9H9P2 273 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 EPHA2P29317 976 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 BMI1P35226 326 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 XCR1P46094 333 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 ZNF74Q16587 644 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 TMEM123Q8N131 208 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-214ENST00000540109 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 GAMTQ14353 236 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-214ENST00000540109 PHYHD1Q5SRE7 291 aa5.5□□□□□ -1.53
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