RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 LRFN5Q96NI6 719 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 TAAR6Q96RI8 345 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 OR51J1Q9H342 316 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 MTCH1Q9NZJ7 389 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 SCN9AQ15858 1988 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 COX7A1P24310 79 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 GALNSP34059 522 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 NPY4RP50391 375 aa8.54□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PS29 197 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 AARDQ4LEZ3 155 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 RPEQ96AT9 228 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 UBE2G2P60604 165 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 PHC2Q8IXK0 858 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM104Q8NE00 496 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 ARL11Q969Q4 196 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 COMMD5Q9GZQ3 224 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 GDF15Q99988 308 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 ARPC3O15145 178 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 UPK1BO75841 260 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 FUT6P51993 359 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 MC2RQ01718 297 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 DOC2BQ14184 412 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 LIPNQ5VXI9 398 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 ELP2Q6IA86 826 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 PAQR8Q8TEZ7 354 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 GPR78Q96P69 363 aa8.52□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 ANGPTL7O43827 346 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 ATF1P18846 271 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 GDNFP39905 211 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 ETV6P41212 452 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
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