RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 CLN8Q9UBY8 286 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-205ENST00000527952 TMCC3Q9ULS5 477 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-205ENST00000527952 V9GYQ6 96 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRJ-205ENST00000527952 C22orf46C9J442 243 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC22A2O15244 555 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 ACSM4P0C7M7 580 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 IRF2P14316 349 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 NUDT2P50583 147 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 COX10Q12887 443 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF181Q2M3W8 571 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 DNM1P34Q6PK57 102 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 SMARCD3Q6STE5 483 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 NLRC3Q7RTR2 1065 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 C7orf34Q96L11 122 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 MARCH7Q9H992 704 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM181BA6NEQ2 426 aa20■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 LCATP04180 440 aa20■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 RHCEP18577 417 aa20■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC18B1Q6NT16 456 aa20■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF841Q6ZN19 808 aa20■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 COLCA1Q6ZS62 124 aa20■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 KIR3DL3Q8N743 410 aa20■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC26A10Q8NG04 563 aa20■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 FANK1Q8TC84 345 aa20■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 PCGF1Q9BSM1 259 aa20■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 EFCAB1Q9HAE3 211 aa20■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 SFTPBP07988 381 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 ANOS1P23352 680 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 GLYATQ6IB77 296 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 RNF148Q8N7C7 305 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 TECTBQ96PL2 329 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 OR52D1Q9H346 318 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 TGP01266 2768 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 RENP00797 406 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 HLA-DQA2P01906 255 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 CA6P23280 308 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 CPT2P23786 658 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 RPS27P42677 84 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 GATA4P43694 442 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 PSME3P61289 254 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 RFX4Q33E94 735 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 GPR157Q5UAW9 335 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 PGM2L1Q6PCE3 622 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 DCDC5Q6ZRR9 648 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 SDR9C7Q8NEX9 313 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 OR11L1Q8NGX0 322 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 ATF6BQ99941 703 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 FUZQ9BT04 418 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 IFT27Q9BW83 186 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 SLITRK2Q9H156 845 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 RASSF4Q9H2L5 321 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 CTSZQ9UBR2 303 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A1B0GWJ7 208 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 CD200P41217 278 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 RAD23AP54725 363 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT72Q14CN4 511 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 OR8G1Q15617 311 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 PGAP1Q75T13 922 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 Q8TCH9 128 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 C5orf63A6NC05 138 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 OR6C68A6NDL8 312 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 SRRM5B3KS81 715 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 C3orf80F5H4A9 247 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 PHYHO14832 338 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC6A6P31641 620 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 SPIBQ01892 262 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 MALLQ13021 153 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 MIDNQ504T8 468 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 OR2AE1Q8NHA4 323 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 DHRS1Q96LJ7 313 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
PTPRJ-205ENST00000527952 ENSAO43768 121 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PTPRJ-205ENST00000527952 KNG1P01042 644 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRJ-205ENST00000527952 GGT2P36268 569 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRJ-205ENST00000527952 PSMB10P40306 273 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRJ-205ENST00000527952 RELBQ01201 579 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRJ-205ENST00000527952 SNAI3Q3KNW1 292 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC36A3Q495N2 470 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRJ-205ENST00000527952 HACD2Q6Y1H2 254 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRJ-205ENST00000527952 Q6YL49 198 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRJ-205ENST00000527952 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PTPRJ-205ENST00000527952 MAP6Q96JE9 813 aa19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms