RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDKN1BP46527 198 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 RORCP51449 518 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 P2RX1P51575 399 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 SIGLEC14Q08ET2 396 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR5I1Q13606 314 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARHGAP19Q14CB8 494 aa-0.62□□□□□ -2.51
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RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC40Q4G0X9 1142 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 TP53I3Q53FA7 332 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM104BQ5XKR9 115 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
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RNU6-287P-201ENST00000516230 OR1J4Q8NGS1 313 aa-0.62□□□□□ -2.51
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RNU6-287P-201ENST00000516230 OR8B2Q96RD0 313 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 RNF2Q99496 336 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 TCHPQ9BT92 498 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRT23Q9C075 422 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
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RNU6-287P-201ENST00000516230 CNIH4Q9P003 139 aa-0.62□□□□□ -2.51
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RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 ACOT9Q9Y305 439 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 ASB3Q9Y575 518 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 ASPMQ8IZT6 3477 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 DYSFO75923 2080 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 SHANK3Q9BYB0 1731 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
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RNU6-287P-201ENST00000516230 CDH23Q9H251 3354 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-287P-201ENST00000516230 CENPBD1B2RD01 187 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 CTAGE5O15320 804 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 STX6O43752 255 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-287P-201ENST00000516230 CEACAM3P40198 252 aa-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-287P-201ENST00000516230 SPINK6Q6UWN8 80 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF410Q86VK4 478 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 TICAM2Q86XR7 235 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 CBWD2Q8IUF1 395 aa-0.63□□□□□ -2.51
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RNU6-287P-201ENST00000516230 LFNGQ8NES3 379 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 LPCAT1Q8NF37 534 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM185AQ8NFB2 350 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR4D6Q8NGJ1 314 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR4C16Q8NGL9 310 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 PYROXD1Q8WU10 500 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 PIK3IP1Q96FE7 263 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 CNDP1Q96KN2 507 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPATA13Q96N96 652 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 PANX2Q96RD6 677 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 RARRES2Q99969 163 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 B9D2Q9BPU9 175 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 NUDT9Q9BW91 350 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 MED4Q9NPJ6 270 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC17A5Q9NRA2 495 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-287P-201ENST00000516230 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa-0.63□□□□□ -2.51
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