RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2V2	Q96R30	315 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	GCM1	Q9NP62	436 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	NPTN	Q9Y639	398 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0R135	149 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	FKBP6	O75344	327 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SELE	P16581	610 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNF1A	P20823	631 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRKACG	P22612	351 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRK5	P34947	590 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PMEL	P40967	661 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ENTPD1	P49961	510 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMP16	P51512	607 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC3A1	Q07837	685 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZMYND11	Q15326	602 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA24	Q86W54	205 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF799	Q96GE5	643 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	MARCH7	Q9H992	704 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF212B	A8MTL3	300 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014		F5H5P2	479 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM178B	H3BS89	294 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	LCAT	P04180	440 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPARC	P09486	303 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF3	P17036	446 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNFRSF1A	P19438	455 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNFSF4	P23510	183 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	FMO3	P31513	532 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPTE	P56180	551 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	CBX1	P83916	185 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDK5	Q00535	292 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF92	Q03936	586 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAB21L1	Q13394	359 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIGD4	Q8IY51	512 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB39B	Q96DA2	213 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIMD4	Q96H15	378 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	AMELY	Q99218	206 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAL3ST1	Q99999	423 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014		H3BN98	237 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SURF4	O15260	269 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFNG	P01579	166 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	HLA-DPB1	P04440	258 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SBK2	P0C263	348 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	OSM	P13725	252 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	GINS1	Q14691	196 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPTSSA	Q969W0	71 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNJ15	Q99712	375 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	OPN4	Q9UHM6	478 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ISPD	A4D126	451 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD300LB	A8K4G0	201 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNGT2	O14610	69 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLCE	O94923	617 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PNP	P00491	289 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC2A1	P11166	492 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANPEP	P15144	967 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCMT1	P22061	227 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	POU1F1	P28069	291 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	GATA4	P43694	442 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRKX	P51817	358 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAD23A	P54725	363 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	BTG1	P62324	171 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM201A	Q5SY85	155 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	DRAM2	Q6UX65	266 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PGAP1	Q75T13	922 aa		10.67	□□□□□ -0.7

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