RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	DCTN3	O75935	186 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	GYPA	P02724	150 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	RAD23A	P54725	363 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC35A2	P78381	396 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	FGFRL1	Q8N441	504 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ST8SIA4	Q92187	359 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	RASD2	Q96D21	266 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	RBP7	Q96R05	134 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	OR52B2	Q96RD2	323 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	EMC7	Q9NPA0	242 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	RNF7	Q9UBF6	113 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276		J3QW42	95 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC22A3	O75751	556 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	FUT1	P19526	365 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	AQP1	P29972	269 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	CD200	P41217	278 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	NPTX1	Q15818	432 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	DTX3	Q8N9I9	347 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SMYD1	Q8NB12	490 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF583	Q96ND8	569 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	WAC	Q9BTA9	647 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ALG12	Q9BV10	488 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	RAB18	Q9NP72	206 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	POLE4	Q9NR33	117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	LCE6A	A0A183	80 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A1W2PRX2	142 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	OOEP	A6NGQ2	149 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	FBP2	O00757	339 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	CHST1	O43916	411 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC22	O60826	627 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	SERPINB7	O75635	380 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	OR7A10	O76100	309 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	DBH	P09172	617 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	LAPTM4A	Q15012	233 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276		Q8N7P7	452 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	FNDC8	Q8TC99	324 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	C17orf50	Q8WW18	174 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	RORB	Q92753	470 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	GTF2H4	Q92759	462 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	TNFRSF14	Q92956	283 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	MPP4	Q96JB8	637 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF702P	Q9H963	129 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	WDR76	Q9H967	626 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	UBD	O15205	165 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC22A2	O15244	555 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	TSPAN19	P0C672	248 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	PF4V1	P10720	104 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	FAH	P16930	419 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	RGS6	P49758	472 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	PRSS12	P56730	875 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	ACSM1	Q08AH1	577 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	POU4F2	Q12837	409 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	SCARB2	Q14108	478 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM53C-208	ENST00000511276	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69

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