RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF691Q5VV52 312 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 OR52H1Q8NGJ2 320 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 UBE2FQ969M7 185 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 HAVCR1Q96D42 359 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 KITLGP21583 273 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 CAPGP40121 348 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 CX3CR1P49238 355 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 PRKXP51817 358 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 EFNA4P52798 201 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 ACTC1P68032 377 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 ACTA1P68133 377 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 IL5RAQ01344 420 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 EGR3Q06889 387 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 TESK1Q15569 626 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 SPATC1Q76KD6 591 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 LRP11Q86VZ4 500 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF679Q8IYX0 411 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 AMELYQ99218 206 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 ACOD1A6NK06 481 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 CLPTM1O96005 669 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 F12P00748 615 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 ADRA2AP08913 450 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 PCGF3Q3KNV8 242 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 SPNS3Q6ZMD2 512 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 OR8B4Q96RC9 309 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 DIRC2Q96SL1 478 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 XRCC2O43543 280 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP6V1G2O95670 118 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 CSF3P09919 207 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 CFL1P23528 166 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 MPV17P39210 176 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 DSCR9P59020 149 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 PSG7Q13046 419 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM209AQ5JX71 171 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 Q5PR19 223 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 CMBLQ96DG6 245 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 PTTG3PQ9NZH4 202 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV4-39P01824 125 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 RIDAP52758 137 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 HCCSP53701 268 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 CXCR4P61073 352 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRN1Q6UXK5 716 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 ITFG2Q969R8 447 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 RNFT2Q96EX2 444 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 OR10A2Q9H208 303 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 RGCCQ9H4X1 137 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF391Q9UJN7 358 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 LRP12Q9Y561 859 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 C17orf100A8MU93 164 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 ALDH3B1P43353 468 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 PGAP1Q75T13 922 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 NAA40Q86UY6 237 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 OR10H4Q8NGA5 316 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 IKZF2Q9UKS7 526 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 COPS3Q9UNS2 423 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 IRGMA1A4Y4 181 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 FADS2O95864 444 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 DBTP11182 482 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 HSPA13P48723 471 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF81P51508 661 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 MMP15P51511 669 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB40BQ12829 278 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL22Q53GT1 634 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 EGFL6Q8IUX8 553 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 NRG4Q8WWG1 115 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 SORCS2Q96PQ0 1159 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 POFUT1Q9H488 388 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 SULT1C4O75897 302 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT8P05787 483 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 ADH4P08319 380 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF91Q05481 1191 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 SNAI3Q3KNW1 292 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 TFAP2CQ92754 450 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 SPSB4Q96A44 273 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-212ENST00000508338 PGAM5Q96HS1 289 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms