RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492262.1

ZNF638-223, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-223	ENST00000492262	CCRL2	O00421	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	AIRE	O43918	545 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TSPAN2	O60636	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	RCBTB2	O95199	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	IFNA16	P05015	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	HBQ1	P09105	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	IFI30	P13284	250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CA6	P23280	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	GADD45A	P24522	165 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	HTR1F	P30939	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	MAGEB1	P43366	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	OR1D4	P47884	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	NPBWR1	P48145	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	RGS6	P49758	472 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	BPIFB3	P59826	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	VBP1	P61758	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ACY1	Q03154	408 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TMED1	Q13445	227 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	FHL1	Q13642	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SSX1	Q16384	188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	DGUOK	Q16854	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	GUSBP11	Q6P575	273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ULK3	Q6PHR2	472 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	OR2T33	Q8NG76	320 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	PFN4	Q8NHR9	129 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TSLP	Q969D9	159 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	BORCS5	Q969J3	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	LRR1	Q96L50	414 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	MGLL	Q99685	303 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF649	Q9BS31	505 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	NUDT9	Q9BW91	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	MND1	Q9BWT6	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	C12orf10	Q9HB07	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	MED31	Q9Y3C7	131 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CACNA1C	Q13936	2221 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262		A8MU76	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262		M0R3G1	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	HCN1	O60741	890 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CSTA	P01040	98 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC2A5	P22732	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CDKN1A	P38936	164 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CRYBB2	P43320	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SERPINB10	P48595	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	UCP2	P55851	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	WNT4	P56705	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	PSPH	P78330	225 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	CCL7	P80098	99 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ZNF638-223	ENST00000492262	SKP2	Q13309	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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