RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 TAS2R19P59542 299 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 TNNC1P63316 161 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 SPIBQ01892 262 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 DUSP7Q16829 419 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 KLHL40Q2TBA0 621 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 CARD16Q5EG05 197 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 DMRTC1Q5HYR2 192 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 Q6ZN92 141 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 ACP7Q6ZNF0 438 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 UNC93AQ86WB7 457 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 FDCSPQ8NFU4 85 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10G3Q8NGC4 313 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 FANK1Q8TC84 345 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 CT55Q8WUE5 264 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 OR8D1Q8WZ84 308 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 ARPC1AQ92747 370 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 CMTM7Q96FZ5 175 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 TIMD4Q96H15 378 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 RASL11BQ9BPW5 248 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB34Q9BZG1 259 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 C20orf85Q9H1P6 137 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 REEP4Q9H6H4 257 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 CISHQ9NSE2 258 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 VANGL2Q9ULK5 521 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 HS3ST2Q9Y278 367 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 CACNG2Q9Y698 323 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 CR1P17927 2039 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 TGP01266 2768 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 TENM1Q9UKZ4 2725 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 TSPAN11A1L157 253 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 ARGFXA6NJG6 315 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 MED7O43513 233 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 RAMP3O60896 148 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 SNNO75324 88 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 CA11O75493 328 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 GIPP09681 153 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 CHTF8P0CG12 524 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 ICAM2P13598 275 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 CCNCP24863 283 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 LONP1P36776 959 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 RPS10P46783 165 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 GSSP48637 474 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 ASPHQ12797 758 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 OXA1LQ15070 435 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 CYTH1Q15438 398 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 MPPED2Q15777 294 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 NRF1Q16656 503 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 MICBQ29980 383 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 PARP15Q460N3 678 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 SFT2D3Q587I9 215 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 OR4F3Q6IEY1 312 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 HSDL2Q6YN16 418 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 NLRP9Q7RTR0 991 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFB106AQ8N104 65 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 MFSD9Q8NBP5 474 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 STEAP2Q8NFT2 490 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 OR52H1Q8NGJ2 320 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 OR52M1Q8NGK5 317 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC37A2Q8TED4 501 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 NAT6Q93015 286 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 IL22RA2Q969J5 263 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2E3Q969T4 207 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC38A2Q96QD8 506 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 NPAS2Q99743 824 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 NRIP2Q9BQI9 281 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 DDA1Q9BW61 102 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 TM6SF2Q9BZW4 377 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 ACTR6Q9GZN1 396 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 YY1AP1Q9H869 796 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 GORASP2Q9H8Y8 452 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC39A1Q9NY26 324 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 SEC14L3Q9UDX4 400 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 NCKAP5O14513 1909 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 SONP18583 2426 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 RYR2Q92736 4967 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 VWFP04275 2813 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAH9Q9NYC9 4486 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-211ENST00000489450 RYR1P21817 5038 aa2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms