RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488175.5

GCOM1-210, Transcript of GRINL1A complex locus 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GCOM1, Length 2,601 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1-210ENST00000488175 RNF126Q9BV68 326 aa14.6□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.6□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 H0YIZ8 118 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 FGF16O43320 207 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 SSX5O60225 188 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 AHSA1O95433 338 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 RAB6AP20340 208 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 FOXL2P58012 376 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 TMEM244Q5VVB8 128 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 PCNX3Q9H6A9 2034 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 EPOPA6NHQ4 379 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 TSPAN2O60636 221 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 ZNF217O75362 1048 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 ADAP1O75689 374 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 BAP18Q8IXM2 172 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 ARL5BQ96KC2 179 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 TREM1Q9NP99 234 aa14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCOM1-210ENST00000488175 MSGN1A6NI15 193 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 ZNF98A6NK75 572 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 ABCD3P28288 659 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 QRFPP83859 136 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 OR4K15Q8NH41 348 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 EMC6Q9BV81 110 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 MS4A18H0YCH9 400 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 SYT7O43581 403 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 NPY4RP50391 375 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 NSDHLQ15738 373 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 MS4A18Q3C1V0 323 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 AWAT2Q6E213 333 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 PDE7BQ9NP56 450 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.58□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 DBX1A6NMT0 343 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 TTRP02766 147 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 NPBWR1P48145 328 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 PNLIPRP2P54317 469 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 CUTCQ9NTM9 273 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 F8VVB4 439 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 F8VWA3 439 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 CD79AP11912 226 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 MPZP25189 248 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 SGCAQ16586 387 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 MICBQ29980 383 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 GRINAQ7Z429 371 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 TMEM104Q8NE00 496 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 RNF141Q8WVD5 230 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 ARL11Q969Q4 196 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 SOX7Q9BT81 388 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.57□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 NFYBP25208 207 aa14.56□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 EMP2P54851 167 aa14.56□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.56□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.56□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 STOML3Q8TAV4 291 aa14.56□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.56□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.56□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 HRH4Q9H3N8 390 aa14.56□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 FAM206AQ9NX38 181 aa14.56□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.56□□□□□ -0.08
GCOM1-210ENST00000488175 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms