RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487008.1

RAB17-211, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB17, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-211	ENST00000487008	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	SPRY3	O43610	288 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	BAG2	O95816	211 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	APOC1	P02654	83 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	ACHE	P22303	614 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	HSD11B1	P28845	292 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	OPRL1	P41146	370 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	GGTLC2	Q14390	218 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	GID4	Q8IVV7	300 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	AMELY	Q99218	206 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	CHODL	Q9H9P2	273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	MSL2	Q9HCI7	577 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	DECR2	Q9NUI1	292 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	LY6G6D	O95868	133 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	HEXA	P06865	529 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	LYNX1	P0DP58	116 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	SELE	P16581	610 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	ALOX5AP	P20292	161 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	CX3CR1	P49238	355 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	CDC42	P60953	191 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	CDK5R2	Q13319	367 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	RIN1	Q13671	783 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	OR2T2	Q6IF00	324 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	THEM6	Q8WUY1	208 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	EME1	Q96AY2	570 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	RP2	O75695	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	CD55	P08174	381 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	SLC2A1	P11166	492 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	TNFSF4	P23510	183 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	COL8A2	P25067	703 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	CRYBB2	P43320	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008		Q6ZR03	302 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	USP51	Q70EK9	711 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	PGAP1	Q75T13	922 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	OR5AS1	Q8N127	324 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	YIPF5	Q969M3	257 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	OPA3	Q9H6K4	179 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	SP140L	Q9H930	580 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	CDC14B	O60729	498 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	TMEM33	P57088	247 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	OR8G5	Q8NG78	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	MBOAT4	Q96T53	435 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	SLC29A1	Q99808	456 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	C5orf63	A6NC05	138 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008		E9PQ18	207 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	XRCC2	O43543	280 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	ANOS1	P23352	680 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	HTR1F	P30939	366 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	HCCS	P53701	268 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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