RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470953.1

VARS-222, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene VARS, Length 392 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-222	ENST00000470953	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953		Q96M85	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GYG2	O15488	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SGCE	O43556	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	KRT36	O76013	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SNAP29	O95721	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CST2	P09228	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF35	P13682	527 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CTLA4	P16410	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FPR3	P25089	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CRABP1	P29762	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	MAGEB1	P43366	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OMP	P47874	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ERVS71-1	P61550	626 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF154	Q13106	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	AQP6	Q13520	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FLOT2	Q14254	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SEC23B	Q15437	767 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	HIST3H3	Q16695	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF774	Q6NX45	483 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LRP11	Q86VZ4	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953		Q8NFD4	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	THTPA	Q9BU02	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR52D1	Q9H346	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953		U3KQV3	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms