RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC3A1Q07837 685 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 CDK5R2Q13319 367 aa12.54□□□□□ -0.4
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SH3BP1-205ENST00000466097 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC35D3Q5M8T2 416 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ZFP1Q6P2D0 407 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 DRAM2Q6UX65 266 aa12.54□□□□□ -0.4
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SH3BP1-205ENST00000466097 DPY19L4Q7Z388 723 aa12.54□□□□□ -0.4
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SH3BP1-205ENST00000466097 TIMD4Q96H15 378 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNJ15Q99712 375 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 TVP23BQ9NYZ1 205 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 FBN3Q75N90 2809 aa12.53□□□□□ -0.4
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SH3BP1-205ENST00000466097 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
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SH3BP1-205ENST00000466097 TRIP10Q15642 601 aa12.53□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 KDM4DQ6B0I6 523 aa12.53□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 OR2T2Q6IF00 324 aa12.53□□□□□ -0.4
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SH3BP1-205ENST00000466097 OR5AS1Q8N127 324 aa12.53□□□□□ -0.4
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SH3BP1-205ENST00000466097 PYDC1Q8WXC3 89 aa12.53□□□□□ -0.4
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SH3BP1-205ENST00000466097 OSBPL10Q9BXB5 764 aa12.53□□□□□ -0.4
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SH3BP1-205ENST00000466097 TOR3AQ9H497 397 aa12.53□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 JMJD1CQ15652 2540 aa12.53□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 WNK2Q9Y3S1 2297 aa12.53□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa12.52□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 IQCF6A8MYZ5 107 aa12.52□□□□□ -0.41
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SH3BP1-205ENST00000466097 PRKXP51817 358 aa12.52□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 LCN1P1Q5VSP4 162 aa12.52□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 Q6ZR03 302 aa12.52□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 SPATC1Q76KD6 591 aa12.52□□□□□ -0.41
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SH3BP1-205ENST00000466097 SLC2A5P22732 501 aa12.51□□□□□ -0.41
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SH3BP1-205ENST00000466097 CLDND2Q8NHS1 167 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 OTOSQ8NHW6 89 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 THEM6Q8WUY1 208 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF133Q8WVZ7 376 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
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SH3BP1-205ENST00000466097 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
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SH3BP1-205ENST00000466097 SAC3D1A6NKF1 404 aa12.5□□□□□ -0.41
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SH3BP1-205ENST00000466097 TGFAP01135 160 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 H2BFMP0C1H6 154 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 CX3CR1P49238 355 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 SRP9P49458 86 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 RAD23AP54725 363 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 MVKQ03426 396 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 SNAI3Q3KNW1 292 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 AVPI1Q5T686 147 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-205ENST00000466097 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
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