RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 CHIAQ9BZP6 476 aa21.92■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 CAPN7Q9Y6W3 813 aa21.92■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1W2PRQ8 180 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 CLPSL1A2RUU4 121 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 GSTA4O15217 222 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 FAM20BO75063 409 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 SERPINA1P01009 418 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 LIPFP07098 398 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 H1F0P07305 194 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 MELTFP08582 738 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 CFHR2P36980 270 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 OMPP47874 163 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 FXYD6P3P58550 94 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 DGCR6Q14129 220 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 KCNJ8Q15842 424 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 CORO6Q6QEF8 472 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 TSSK2Q96PF2 358 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 TECTBQ96PL2 329 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 TMCC3Q9ULS5 477 aa21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa21.9■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF879B4DU55 563 aa21.9■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 M0QZ24 198 aa21.9■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 DCTN6O00399 190 aa21.9■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 SLC22A2O15244 555 aa21.9■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 ACSM4P0C7M7 580 aa21.9■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 ECH1Q13011 328 aa21.9■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 MALLQ13021 153 aa21.9■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 CCT8L2Q96SF2 557 aa21.9■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 MMP27Q9H306 513 aa21.9■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 ERVK-18Q9QC07 812 aa21.9■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PBRM1-218ENST00000458294 TIMM23O14925 209 aa21.89■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SFTPBP07988 381 aa21.89■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 PDCD1Q15116 288 aa21.89■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa21.89■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 HDXQ7Z353 690 aa21.89■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 C19orf18Q8NEA5 215 aa21.89■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SSMEM1Q8WWF3 244 aa21.89■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 GATAD2BQ8WXI9 593 aa21.89■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 ATF6BQ99941 703 aa21.89■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 VIPAS39Q9H9C1 493 aa21.89■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 B9D1Q9UPM9 204 aa21.89■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 AURKCQ9UQB9 309 aa21.89■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 F5H5K5 113 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 TOX4O94842 621 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 PPP1R3DO95685 299 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 MMP9P14780 707 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 MDH1P40925 334 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 PRSS12P56730 875 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 MPPED2Q15777 294 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 FGD3Q5JSP0 725 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SLC18B1Q6NT16 456 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SMARCD3Q6STE5 483 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF620Q6ZNG0 422 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 CFAP77Q6ZQR2 320 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 PGAP1Q75T13 922 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SLC26A10Q8NG04 563 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 PITX2Q99697 317 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SLC22A4Q9H015 551 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 FN3KRPQ9HA64 309 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 UFSP2Q9NUQ7 469 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 RNF7Q9UBF6 113 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 CTSZQ9UBR2 303 aa21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 UNC119BA6NIH7 251 aa21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SLC36A3Q495N2 470 aa21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 OR6V1Q8N148 313 aa21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 TBC1D15Q8TC07 691 aa21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 DYRK2Q92630 601 aa21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 FAM162AQ96A26 154 aa21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SLCO4A1Q96BD0 722 aa21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 TBX15Q96SF7 602 aa21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 TRIM36Q9NQ86 728 aa21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 ACOXLQ9NUZ1 547 aa21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa21.87■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 LGALS8O00214 317 aa21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 NME4O00746 187 aa21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 LCATP04180 440 aa21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 RHCEP18577 417 aa21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SLC7A2P52569 658 aa21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 OR8G1Q15617 311 aa21.86■■□□□ 1.09
PBRM1-218ENST00000458294 CGB2Q6NT52 195 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms