RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF878	C9JN71	531 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	CD8A	P01732	235 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	RAB3A	P20336	220 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	CXCL12	P48061	93 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	FOXK1	P85037	733 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	MFAP5	Q13361	173 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	CDNF	Q49AH0	187 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM65	Q6PI78	240 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	GPAT4	Q86UL3	456 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	PRRT1	Q99946	306 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	VSIG4	Q9Y279	399 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	OPN1LW	P04000	364 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	GSK3A	P49840	483 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	ZMYND11	Q15326	602 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	OR6X1	Q8NH79	312 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC120	Q96HB5	630 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	MFF	Q9GZY8	342 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		15.02	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1W2PNR3	127 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	SCGN	O76038	276 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	MPG	P29372	298 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	OR5B2	Q96R09	309 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	SCO1	O75880	301 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	CXADR	P78310	365 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	KCNMB1	Q16558	191 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	HIST3H3	Q16695	136 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	FADS6	Q8N9I5	356 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	CXorf58	Q96LI9	332 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	OXGR1	Q96P68	337 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	RASL10B	Q96S79	203 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	CSN2	P05814	226 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	ZBTB25	P24278	435 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	CDA	P32320	146 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	CD163	Q86VB7	1156 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	CHST4	Q8NCG5	386 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	COQ8A	Q8NI60	647 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		15	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF20	P17024	532 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	CD34	P28906	385 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	SLC51B	Q86UW2	128 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	OR5AS1	Q8N127	324 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	BEST3	Q8N1M1	668 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	SPEG	Q15772	3267 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	VCAN	P13611	3396 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	SIGLEC6	O43699	453 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	RAMP1	O60894	148 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	IL2RA	P01589	272 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	CYC1	P08574	325 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	HLA-G	P17693	338 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	AGTR1	P30556	359 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	GABRE	P78334	506 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	FGL1	Q08830	312 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TOM1-210	ENST00000449058	OR52W1	Q6IF63	320 aa		14.99	□□□□□ -0.01

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