RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 AHSPQ9NZD4 102 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 A0A0A6YYH2 397 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 A6NJ64 397 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 MMP9P14780 707 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CHRNB4P30926 498 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 BRS3P32247 399 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 HRH1P35367 487 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 DIO1P49895 249 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM33P57088 247 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 DCAF7P61962 342 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM239Q8WW34 195 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CMBLQ96DG6 245 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 OR10C1Q96KK4 312 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CLDND1Q9NY35 253 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 KLK13Q9UKR3 277 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 UTRNP46939 3433 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 PLPP1O14494 284 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 EFSO43281 561 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 DOK2O60496 412 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CDC14BO60729 498 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 LILRB3O75022 631 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CNMDO75829 334 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 GCGP01275 180 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 SLC35G6P0C7Q6 338 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF735P0CB33 412 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 MPC1LP0DKB6 136 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 FGF5P12034 268 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CTHP32929 405 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 SLC6A9P48067 706 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CX3CR1P49238 355 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ASCL1P50553 236 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TAS2R38P59533 333 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 PRPS1P60891 318 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 SLC35A1P78382 337 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 GAS6Q14393 721 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TPGS2Q68CL5 300 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ZNRF4Q8WWF5 429 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 COL26A1Q96A83 441 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 IL17FQ96PD4 163 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 SYT3Q9BQG1 590 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CHST11Q9NPF2 352 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 HAO2Q9NYQ3 351 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 DOCK6Q96HP0 2047 aa8.59□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 NPIPA7E9PJI5 369 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 NPIPA8P0DM63 369 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 CD33P20138 364 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 FRKP42685 505 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 GABRA4P48169 554 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 MMP16P51512 607 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 SQSTM1Q13501 440 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 P2RY6Q15077 328 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 SYS1Q8N2H4 156 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF480Q8WV37 535 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 FAM46BQ96A09 425 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 SDSLQ96GA7 329 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 NMNAT3Q96T66 252 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 NMES1Q9C002 83 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 ICKQ9UPZ9 632 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 FEZF1A0PJY2 475 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 ARL5CA6NH57 179 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 A6NIZ1 184 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 M0QZ24 198 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 TSPAN6O43657 245 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 CIDEAO60543 219 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 JTBO76095 146 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 AGR2O95994 175 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD1-203ENST00000395211 HPRT1P00492 218 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms