RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382045.3

LINC00487-201, long intergenic non-protein coding RNA 487, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00487, Length 2,131 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00487-201ENST00000382045 EDEM2Q9BV94 578 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 H3BUI4 141 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 SULT2B1O00204 365 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 RER1O15258 196 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 UMODP07911 640 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 QDPRP09417 244 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 KCNMB1Q16558 191 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 OR4S1Q8NGB4 309 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 FAM46BQ96A09 425 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 CMBLQ96DG6 245 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 D6RAR5 112 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 CFIP05156 583 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 ANOS1P23352 680 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 PRKXP51817 358 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 CAMK2BQ13554 666 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 FJX1Q86VR8 437 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 EDAQ92838 391 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 MARVELD3Q96A59 401 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 SLC6A7Q99884 636 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 GSX2Q9BZM3 304 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 GLTPQ9NZD2 209 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00487-201ENST00000382045 YKT6O15498 198 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 ARPC5O15511 151 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 SLC2A1P11166 492 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 COX6A1P12074 109 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 ZNF20P17024 532 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 SLC35A1P78382 337 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 TAF13Q15543 124 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 SOX7Q9BT81 388 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 OR14I1A6ND48 311 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 ZNF726A6NNF4 738 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 TDGF1P13385 188 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 ABOP16442 354 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 H3F3AP84243 136 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 MEF2DQ14814 521 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 C11orf88Q6PI97 169 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 ASB13Q8WXK3 278 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 A0A087WZY1 265 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 ZNF17P17021 662 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 S100A11P31949 105 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 RAB14P61106 215 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 CDNFQ49AH0 187 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 AWAT2Q6E213 333 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 OPN5Q6U736 354 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 RNF144BQ7Z419 303 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 OR5AS1Q8N127 324 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 MR1Q95460 341 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 GPR84Q9NQS5 396 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 SCGNO76038 276 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 CCL3P10147 92 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 CCL1P22362 96 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 CX3CR1P49238 355 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 CLDN17P56750 224 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00487-201ENST00000382045 EXT1Q16394 746 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms