RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379918.8

CAGE1-203, Transcript of cancer antigen 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAGE1, Length 2,877 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	GKN2	Q86XP6	184 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC25A45	Q8N413	288 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	NAXE	Q8NCW5	288 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	KCNK17	Q96T54	332 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	DOCK7	Q96N67	2140 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918		A0A1B0GTI1	187 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918		A0A1B0GTQ1	180 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	MSGN1	A6NI15	193 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	SYT7	O43581	403 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	PMS2P2	O95744	297 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	MPIG6B	O95866	241 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	MT-ATP6	P00846	226 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ZBTB25	P24278	435 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	AWAT2	Q6E213	333 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	PXT1	Q8NFP0	134 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	AQP3	Q92482	292 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	LRRC46	Q96FV0	321 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	C9orf170	A2RU37	121 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	C5orf51	A6NDU8	294 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	OR6C76	A6NM76	312 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	LMO7DN	F2Z398	122 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	PHYH	O14832	338 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	CD74	P04233	296 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	PGAM2	P15259	253 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	PNLIPRP2	P54317	469 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	CLDN6	P56747	220 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	GMFB	P60983	142 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	MYBPH	Q13203	477 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	MICB	Q29980	383 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918		A0A0B4J2A0	478 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918		H0YIZ8	118 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	SULT2B1	O00204	365 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	IGLV3-19	P01714	112 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF17	P17021	662 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	NAGA	P17050	411 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	FST	P19883	344 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	CD27	P26842	260 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	CRABP1	P29762	137 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	BDKRB2	P30411	391 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	SERPINF1	P36955	418 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	CASR	P41180	1078 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	STAR	P49675	285 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	QRFP	P83859	136 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	TDG	Q13569	410 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	GUCA2B	Q16661	112 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CAGE1-203	ENST00000379918	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41

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