RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PRODHO43272 600 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 HLA-DQA2P01906 255 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 MSMBP08118 114 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CD55P08174 381 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF823P16415 610 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 KITLGP21583 273 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PCMT1P22061 227 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 FMO3P31513 532 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CRISP1P54107 249 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CDC42P60953 191 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 LMO4P61968 165 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H3AP68431 136 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 GINS1Q14691 196 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SNAPC1Q16533 368 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CORO6Q6QEF8 472 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR51F2Q8NH61 342 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 EME1Q96AY2 570 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TIMD4Q96H15 378 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RDH12Q96NR8 316 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 COQ7Q99807 217 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 STARD10Q9Y365 291 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.5□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ERICH4A6NGS2 130 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SURF4O15260 269 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 MPZL2O60487 215 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 BAG2O95816 211 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV2-5P01817 119 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ALPLP05186 524 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RAC2P15153 192 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PRKACGP22612 351 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TNFSF4P23510 183 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 DAPP51397 102 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CDK5Q00535 292 aa6.49□□□□□ -1.37
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC3A1Q07837 685 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CDK5R2Q13319 367 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CRMP1Q14194 572 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SPRNQ5BIV9 151 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZR03 302 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 GID4Q8IVV7 300 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CCL17Q92583 94 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RAB1CQ92928 201 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RFKQ969G6 155 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM186Q96B77 213 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 RAB39BQ96DA2 213 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CMBLQ96DG6 245 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PITX2Q99697 317 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 ATF6BQ99941 703 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PKP2Q99959 881 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 VCX3BQ9H321 246 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.49□□□□□ -1.37
SGMS1-201ENST00000361543 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.49□□□□□ -1.37
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