RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 EMC9Q9Y3B6 208 aa16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 TSPAN15O95858 294 aa16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 VIPR2P41587 438 aa16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 RAB5CP51148 216 aa16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF616Q08AN1 781 aa16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 UNC119Q13432 240 aa16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 MIDNQ504T8 468 aa16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 CBLN3Q6UW01 205 aa16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 SGK3Q96BR1 496 aa16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 OR5B2Q96R09 309 aa16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 ZBP1Q9H171 429 aa16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 PARP11Q9NR21 331 aa16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa16.89■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 URADA6NGE7 173 aa16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 H0YGG7 62 aa16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF141Q15928 474 aa16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM128Q5BJH2 165 aa16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 HOGA1Q86XE5 327 aa16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 THRSPQ92748 146 aa16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 APBB3O95704 486 aa16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 MEGF10Q96KG7 1140 aa16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 IER2Q9BTL4 223 aa16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 MAFFQ9ULX9 164 aa16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 LRP12Q9Y561 859 aa16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 ATG2BQ96BY7 2078 aa16.88■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 CXorf65A6NEN9 183 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 ASAH2BP0C7U1 165 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 S1PR1P21453 382 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 ITGA3P26006 1051 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 P2RY4P51582 365 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 NDUFA6P56556 154 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 PDGFRLQ15198 375 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 FDX2Q6P4F2 183 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 FIGLAQ6QHK4 219 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 OR13C9Q8NGT0 318 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 PIGQQ9BRB3 760 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 A0A0A6YYH2 397 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 A6NJ64 397 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 UMAD1C9J7I0 102 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 FOXS1O43638 330 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 SLC16A7O60669 478 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 RPS10P46783 165 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 RIDAP52758 137 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 ZP2Q05996 745 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 CD226Q15762 336 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 ACTBL2Q562R1 376 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 TEX30Q5JUR7 227 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 SLC18B1Q6NT16 456 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 C14orf144Q96I85 54 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 LYRM4Q9HD34 91 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 UFSP2Q9NUQ7 469 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 DEC1Q9P2X7 70 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 MPZL1O95297 269 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 SFT2D2O95562 160 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 ADH1AP07327 375 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 CD63P08962 238 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 HKR1P10072 659 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 MPZP25189 248 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 FHITP49789 147 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 TAS2R31P59538 309 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 GUK1Q16774 197 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 SSX9Q7RTT3 188 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 TAF8Q7Z7C8 310 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 CATSPERDQ86XM0 798 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 CA13Q8N1Q1 262 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 NICN1Q9BSH3 213 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 HDAC8Q9BY41 377 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 FBXL17Q9UF56 701 aa16.87■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 HIDE1A8MVS5 230 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 H7C1Q1 480 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 FGF19O95750 216 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 TXNDC12O95881 172 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 OR13C7P0DN81 318 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 PMELP40967 661 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 CLDN6P56747 220 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 AGBL4Q5VU57 503 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 C1QL3Q5VWW1 255 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM104Q8NE00 496 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 TERB2Q8NHR7 220 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 TAAR8Q969N4 342 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 S100PBPQ96BU1 408 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 ABHD6Q9BV23 337 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 SLC26A1Q9H2B4 701 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 RAB18Q9NP72 206 aa16.86■□□□□ 0.29
PRPF39-201ENST00000355765 RAB22AQ9UL26 194 aa16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms