RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 GPR84Q9NQS5 396 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 NPAP1Q9NZP6 1156 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 EMC3Q9P0I2 261 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 CACNG2Q9Y698 323 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 DCHS1Q96JQ0 3298 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 CD300CQ08708 224 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 C2orf76Q3KRA6 126 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 TOMM5Q8N4H5 51 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 C15orf40Q8WUR7 153 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 PLEKHA1Q9HB21 404 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 GPR35Q9HC97 309 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 SLC17A5Q9NRA2 495 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 LIPGQ9Y5X9 500 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 GNALP38405 381 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 C1orf100Q5SVJ3 147 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 GLYATL3Q5SZD4 288 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 KRT74Q7RTS7 529 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 COMMD2Q86X83 199 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 LYPD6Q86Y78 171 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 FDCSPQ8NFU4 85 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 OR1M1Q8NGA1 313 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 HPS1Q92902 700 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 FOXB1Q99853 325 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 AUNIPQ9H7T9 357 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 PLEK2Q9NYT0 353 aa23.56■■□□□ 1.36
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HOXD8-201ENST00000313173 TAS2R20P59543 309 aa23.55■■□□□ 1.36
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HOXD8-201ENST00000313173 CEACAM16Q2WEN9 425 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF529Q6P280 563 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD16Q6P6B7 361 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 DOK3Q7L591 496 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 OR5D14Q8NGL3 314 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 NLKQ9UBE8 527 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 APOC1P02654 83 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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HOXD8-201ENST00000313173 CLN3Q13286 438 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF813Q6ZN06 617 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 GLCCI1Q86VQ1 547 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 JAGN1Q8N5M9 183 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 PGAM5Q96HS1 289 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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HOXD8-201ENST00000313173 F5H5K5 113 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 B4GALT1P15291 398 aa23.54■■□□□ 1.36
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HOXD8-201ENST00000313173 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
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HOXD8-201ENST00000313173 RNF122Q9H9V4 155 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM138Q9NPI0 162 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 PARPBPQ9NWS1 579 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 XRCC3O43542 346 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 CTAG2O75638 210 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 RAB3AP20336 220 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 RNFT1Q5M7Z0 435 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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HOXD8-201ENST00000313173 FNDC9Q8TBE3 224 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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HOXD8-201ENST00000313173 KCNK15Q9H427 330 aa23.53■■□□□ 1.36
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HOXD8-201ENST00000313173 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF724A8MTY0 619 aa23.53■■□□□ 1.36
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HOXD8-201ENST00000313173 SLC6A9P48067 706 aa23.53■■□□□ 1.36
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HOXD8-201ENST00000313173 SLC22A24Q8N4F4 322 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF799Q96GE5 643 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 SORCS2Q96PQ0 1159 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 PRRG4Q9BZD6 226 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 LDAHQ9H6V9 325 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 BCO1Q9HAY6 547 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF407Q9C0G0 2248 aa23.52■■□□□ 1.36
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