RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 FOSL1P15407 271 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 CLN3Q13286 438 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ZADH2Q8N4Q0 377 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ARSGQ96EG1 525 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf90Q96M02 699 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 RNF32Q9H0A6 362 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 CYSLTR2Q9NS75 346 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 K7EQM0 130 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 BHLHE40O14503 412 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SIRT6Q8N6T7 355 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 EGLN1Q9GZT9 426 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 UMAD1C9J7I0 102 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 FABP1P07148 127 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 MGST1P10620 155 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 FZD2Q14332 565 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SPACA5Q96QH8 159 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 C20orf24Q9BUV8 137 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 LAMB1P07942 1786 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SLC17A2O00624 439 aa19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 OR2C1O95371 312 aa19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DL3P43628 341 aa19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT16Q8N428 558 aa19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 OSGIN2Q9Y236 505 aa19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 GALP22466 123 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS36Q5K4E3 855 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 DTWD2Q8NBA8 298 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 CCL11P51671 97 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 OR4C16Q8NGL9 310 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 MARCH1Q8TCQ1 289 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A13Q9NSD5 602 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 DERL3Q96Q80 235 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 GLI4P10075 376 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 GLULP15104 373 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 OPRM1P35372 400 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM268Q5VZI3 342 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 CORO2AQ92828 525 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 BOD1Q96IK1 185 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 PPIL1Q9Y3C6 166 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 HRO43593 1189 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 CCR2P41597 374 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 GABRA4P48169 554 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 FOXJ3Q9UPW0 622 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 BTAF1O14981 1849 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WUJ7 227 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 TGOLN2O43493 480 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 GLB1P16278 677 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 GPNMBQ14956 572 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM196Q5HYL7 178 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 FAM74A1Q5RGS3 127 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 OR5AS1Q8N127 324 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 IFI44Q8TCB0 444 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 WDR1O75083 606 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 IL5P05113 134 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0040Q15053 153 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM229BQ8NBD8 167 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 DLL4Q9NR61 685 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 DHHO43323 396 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 DTYMKP23919 212 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 XAF1Q6GPH4 301 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM7Q9NQW5 492 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SLX4Q8IY92 1834 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 RAB1AP62820 205 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 REEP6Q96HR9 211 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 MSRB3Q8IXL7 192 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 RDH5Q92781 318 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35E1Q96K37 410 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SERTM1A2A2V5 107 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 LILRA5A6NI73 299 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 AKR7A2O43488 359 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 LRP3O75074 770 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 LGALS4P56470 323 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 RAC1P63000 192 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 DHODHQ02127 395 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 PXDC1Q5TGL8 231 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 FAM185AQ8N0U4 392 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf44Q96CB5 159 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 MENTQ9BUN1 341 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 KLK11Q9UBX7 282 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms