RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 HMGN3Q15651 99 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 Q6ZSR9 355 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 PELI1Q96FA3 418 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 CCR2P41597 374 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 DAPP51397 102 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 HTR4Q13639 388 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 RTP5Q14D33 572 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SAXO2Q658L1 398 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 DRAM2Q6UX65 266 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM56Q96MV1 263 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 FITM1A5D6W6 292 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 DBX1A6NMT0 343 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 XRCC3O43542 346 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ALOX5APP20292 161 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF425Q6IV72 752 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OLIG1Q8TAK6 271 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 THYN1Q9P016 225 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 Q8IYB0 196 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OR13C8Q8NGS7 320 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TEAD3Q99594 435 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 FAM221AA4D161 298 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 PMS2P2O95744 297 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 MT-ND4LP03901 98 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 PPP3CBP16298 524 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 MMP11P24347 488 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ACY3Q96HD9 319 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 FCRL1Q96LA6 429 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TCFL5Q9UL49 500 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1W2PR80 420 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TMPRSS11DO60235 418 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SPI1P17947 270 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SOX8P57073 446 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ACOXLQ9NUZ1 547 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ANGPTL7O43827 346 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SULT1C4O75897 302 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OR2J3O76001 311 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SCG5P05408 212 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SSTR2P30874 369 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 FUT6P51993 359 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM99Q8N816 258 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 PBOV1Q9GZY1 135 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 CHD4Q14839 1912 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 RAF1P04049 648 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ATP1B1P05026 303 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 CD82P27701 267 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OPRM1P35372 400 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 PTOV1Q86YD1 416 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OR8B3Q8NGG8 313 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OR8B2Q96RD0 313 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 GPR87Q9BY21 358 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 MASP2O00187 686 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 CCL21O00585 134 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 HPP00738 406 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ZBTB25P24278 435 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 GNG10P50151 68 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 NOXO1Q8NFA2 376 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ACER3Q9NUN7 267 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TSTD3H0UI37 97 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 GPM6AP51674 278 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 AQP6Q13520 282 aa9.54□□□□□ -0.88
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