RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10912Q3UXH0 145 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ly6eQ64253 130 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zrsr1Q64707 428 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Man1c1Q6NXK9 625 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1500Q7TQQ3 311 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdhr3Q8BL00 831 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tctn3Q8R2Q6 595 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sav1Q8VEB2 386 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnk1Q99ML2 666 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrpl15Q9CPR5 295 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mpc2Q9D023 127 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r56Q9EPS9 310 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr930Q9EQ99 308 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Reep6Q9JM62 201 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Obox6G3X9U1 347 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Epha8O09127 1004 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sh2d1bO35324 132 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mtnd4lP03903 98 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PvalbP32848 110 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nos3P70313 1202 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spc25Q3UA16 226 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nup107Q8BH74 926 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam124bQ8BLQ0 456 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrn3Q8CBC6 707 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8R2K8 148 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il24Q925S4 181 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serpinb7Q9D695 380 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr944Q9EQ91 311 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc2a8Q9JIF3 477 aa18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp4a30bA0A087WS15 508 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr911-ps1A0A140T8K0 311 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3543D3Z235 184 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pgam2O70250 253 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spi1P17433 272 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cox4i1P19783 169 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Crabp1P62965 137 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AmbpQ07456 349 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1136Q0VBI4 310 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adam5Q3TTE0 751 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam71f1Q3UZD7 341 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbm38Q62176 237 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SrmsQ62270 496 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptpmt1Q66GT5 193 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DdiasQ6NZG4 898 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Inca1Q6PKN7 231 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pgm2Q7TSV4 620 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ubac2Q8R1K1 345 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brinp1Q920P3 760 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem138Q9D6G5 162 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam89bQ9QUI1 189 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1156A2AVC3 323 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr520E9Q518 316 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10881P01642 115 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P58686 83 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gng2P63213 71 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dppa5bP85965 119 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2210407C18RikQ6YI28 220 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uhrf2Q7TMI3 803 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mboat1Q8BH98 492 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 F830045P16RikQ8BJ95 487 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clec2hQ8C1T8 218 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc24a5Q8C261 501 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eps8l3Q91WL0 600 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eif2b1Q99LC8 305 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PccbQ99MN9 541 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trp53tg5Q9D976 238 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Htr6Q9R1C8 440 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RbpmsQ9WVB0 197 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il18bpQ9Z0M9 193 aa18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm20489A2AGH5 449 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr152G3X9L8 316 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mesp2O08574 370 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MyogP12979 224 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gmeb2P58929 530 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndufb6Q3UIU2 128 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Camk2dQ6PHZ2 499 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prss34Q80UR4 318 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrp12Q8BUJ9 858 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gtf3c1Q8K284 2101 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r89Q8R256 316 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Duoxa1Q8VE49 341 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1277Q8VF41 303 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr214Q8VG27 320 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q91WE4 72 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itfg2Q91WI7 443 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AspmQ8CJ27 3122 aa18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Xlr4aA2BI40 215 aa18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scml2B1AVB3 969 aa18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8281L7N235 204 aa18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8906L7N2A2 181 aa18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rap1aP62835 184 aa18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Xlr4cQ3TKR2 215 aa18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc25a33Q3TZX3 320 aa18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam196aQ3USH1 422 aa18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdp1Q3UV70 538 aa18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr314Q7TRZ7 330 aa18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plppr5Q8BJ52 321 aa18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc25Q8K1T1 297 aa18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr350Q8VFP8 312 aa18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr732Q8VFT5 308 aa18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.7 ms