RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 MESTQ5EB52 335 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL11BQ5VVY1 283 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 NANOGP8Q6NSW7 305 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 LHX4Q969G2 390 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TBX15Q96SF7 602 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 HCAR1Q9BXC0 346 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 UFSP2Q9NUQ7 469 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 RHCGQ9UBD6 479 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS37A4D1T9 235 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 RER1O15258 196 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC16A7O60669 478 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 YAP1P46937 504 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 NPY4RP50391 375 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS12P56730 875 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf68Q2NKX9 166 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKDD1AQ495B1 522 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CYBRD1Q53TN4 286 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 WDFY2Q96P53 400 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3GL1Q99961 368 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 NDEL1Q9GZM8 345 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 A4GNTQ9UNA3 340 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ELOVL7A1L3X0 281 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM20BO75063 409 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV1-69P01742 117 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 LIPFP07098 398 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CD14P08571 375 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 GLB1L2Q8IW92 636 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPEARQ8WU66 669 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 FNDC11Q9BVV2 318 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ATPIF1Q9UII2 106 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ALX3O95076 343 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP9P14780 707 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR4P46093 362 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPAP49450 140 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 LSM6P62312 80 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKCDQ05655 676 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 FHL1Q13642 323 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNJ8Q15842 424 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ERICH5Q6P6B1 374 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PDZD9Q8IXQ8 264 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 SYT4Q9H2B2 425 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CTSZQ9UBR2 303 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0U1RQK1 487 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAM20O43506 726 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 AHCYL1O43865 530 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMB10P40306 273 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 GATA4P43694 442 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAM2Q15035 370 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 FBLN7Q53RD9 439 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF730Q6ZMV8 503 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CALHM3Q86XJ0 350 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8TCH9 128 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 LZICQ8WZA0 190 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ERGIC1Q969X5 290 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 C3orf80F5H4A9 247 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CSF1P09603 554 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 FUT4P22083 530 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 MAB21L1Q13394 359 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 HDHD2Q9H0R4 259 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 DPAGT1Q9H3H5 408 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM96BQ9Y3D0 163 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 IER3P46695 156 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8B8Q15620 311 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBED5Q49AG3 693 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZSV7 163 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 OFCC1Q8IZS5 231 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8J3Q8NGG0 315 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 LRTOMTQ8WZ04 291 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 COQ7Q99807 217 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF7Q9UBF6 113 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS6KA6Q9UK32 745 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-217ENST00000629983 J3KTA2 159 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 LGALS8O00214 317 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 KDELR2P33947 212 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 CD200P41217 278 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 RAD23AP54725 363 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ARF6P62330 175 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 MPPED2Q15777 294 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 LDLRAD3Q86YD5 345 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 GJC3Q8NFK1 279 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SIRPDQ9H106 197 aa22.64■■□□□ 1.21
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