RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	PRPS2	P11908	318 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFB7	P17568	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMB8	P28062	276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP3K8	P41279	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP12A	P54707	1039 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	RAD23A	P54725	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	EGR4	Q05215	589 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MPPED2	Q15777	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	OR8G5	Q8NG78	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT35	Q92764	455 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	BFAR	Q9NZS9	450 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	PAK5	Q9P286	719 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	CLDN24	A6NM45	220 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	DLGAP1	O14490	977 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB4A	O15263	64 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	TIPRL	O75663	272 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	CSTA	P01040	98 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	INHBA	P08476	426 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	SELL	P14151	372 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	DDC	P20711	480 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	VDAC1	P21796	283 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBG1	P23258	451 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP2K6	P52564	334 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	TAF13	Q15543	124 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	MICB	Q29980	383 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	OXGR1	Q96P68	337 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	RARRES2	Q99969	163 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PPH5	198 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	ACOT8	O14734	319 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	ABHD16A	O95870	558 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	HLA-DPB1	P04440	258 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	IL3	P08700	152 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	FPR3	P25089	353 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL4	Q8N3J2	472 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SNAP23-223	ENST00000627440	EMC6	Q9BV81	110 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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