RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	HAUS5	O94927	633 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHG2	P01859	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHG4	P01861	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	PRG2	P13727	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	CHN1	P15882	459 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	GCSH	P23434	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	HTR3A	P46098	478 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ERF	P50548	548 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC25A1	P53007	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	CDKN2D	P55273	166 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SEH1L	Q96EE3	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	LRR1	Q96L50	414 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SNX6	Q9UNH7	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PPE2	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PR64	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PRV1	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	TBX19	O60806	448 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	HTR3B	O95264	441 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	PRPS2	P11908	318 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	NDUFB7	P17568	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	PSMB8	P28062	276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	MAP3K8	P41279	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ATP12A	P54707	1039 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	RAD23A	P54725	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	EGR4	Q05215	589 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	MPPED2	Q15777	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	OR8G5	Q8NG78	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	KRT35	Q92764	455 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	BFAR	Q9NZS9	450 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	PAK5	Q9P286	719 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	CLDN24	A6NM45	220 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	DLGAP1	O14490	977 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	DEFB4A	O15263	64 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	TIPRL	O75663	272 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	CSTA	P01040	98 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	INHBA	P08476	426 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	SELL	P14151	372 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	DDC	P20711	480 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	VDAC1	P21796	283 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	TUBG1	P23258	451 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	MAP2K6	P52564	334 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	MPP2	Q14168	576 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	TAF13	Q15543	124 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	MICB	Q29980	383 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SNAP23-222	ENST00000626061	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.2 ms