RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 CEACAM16Q2WEN9 425 aa18.28■□□□□ 0.52
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CTDP1-208ENST00000613122 TXN2Q99757 166 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-208ENST00000613122 HSPB2A8KAH6 182 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-208ENST00000613122 SNAPINO95295 136 aa18.28■□□□□ 0.52
CTDP1-208ENST00000613122 HSPB2Q16082 182 aa18.28■□□□□ 0.52
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CTDP1-208ENST00000613122 A0A087WUJ7 227 aa18.25■□□□□ 0.51
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CTDP1-208ENST00000613122 SIGLEC14Q08ET2 396 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 AKR7LQ8NHP1 331 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 SPRY3O43610 288 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 GSG1Q2KHT4 349 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM200CA6NKL6 621 aa18.24■□□□□ 0.51
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