RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 MBTPS2O43462 519 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FGF17O60258 216 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TPST2O60704 377 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ENTPD6O75354 484 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 STX11O75558 287 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB36O95755 333 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR75O95800 540 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 EPPINO95925 133 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PTHP01270 115 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DBIP07108 87 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 HSMCR30P0CW71 290 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FGF5P12034 268 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PVRP15151 417 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MMP11P24347 488 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CCKBRP32239 447 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR1D5P58170 312 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NCS1P62166 190 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LSM3P62310 102 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPAN31Q12999 210 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GAGE5Q13069 117 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GAGE6Q13070 117 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FZD2Q14332 565 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GINS1Q14691 196 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MEF2DQ14814 521 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZMYND11Q15326 602 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ELOCQ15369 112 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR1C1Q15619 314 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DUSP5Q16690 384 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHL22Q53GT1 634 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DCST2Q5T1A1 773 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RNLSQ5VYX0 342 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RTL6Q6ICC9 239 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CBLN3Q6UW01 205 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF730Q6ZMV8 503 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF836Q6ZNA1 936 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZS52 159 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OLIG3Q7RTU3 272 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 COMTD1Q86VU5 262 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC22A16Q86VW1 577 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GKN2Q86XP6 184 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 VRK2Q86Y07 508 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF843Q8N446 348 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TCEANCQ8N8B7 351 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 COX18Q8N8Q8 333 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CDRT4Q8N9R6 151 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC16A11Q8NCK7 471 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR13C5Q8NGS8 318 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MCFD2Q8NI22 146 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NDNFQ8TB73 568 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC7A13Q8TCU3 470 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OSTF1Q92882 214 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CDS1Q92903 461 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC41A3Q96GZ6 507 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHA8Q96JA3 519 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 IL4I1Q96RQ9 567 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB40CQ96S21 281 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 STACQ99469 402 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MCHR1Q99705 422 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC61Q9BV99 259 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MND1Q9BWT6 205 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TSSK6Q9BXA6 273 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 UCK1Q9HA47 277 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 AMBNQ9NP70 447 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAP2Q9NPF8 381 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXO8Q9NRD0 319 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CTPS2Q9NRF8 586 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C14orf105Q9NVL8 296 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TVP23BQ9NYZ1 205 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 POMT2Q9UKY4 750 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ERGIC3Q9Y282 383 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNE3Q9Y6H6 103 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A087WUU8 490 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAPPC13A5PLN9 417 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF222A6NCQ9 220 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 METTL15A6NJ78 407 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SHISA7A6NL88 538 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 J3QRK9 145 aa3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms