RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 V9GY05 133 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 URB1O60287 2271 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1B0GTI1 187 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 P2RY10O00398 339 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC19A2O60779 497 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLV3-1P01715 115 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ADRA2CP18825 462 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CFPP27918 469 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PSG4Q00888 419 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2A2Q6IF42 318 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 BTLAQ7Z6A9 289 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 OR8B12Q8NGG6 310 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 WNT5BQ9H1J7 359 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A18Q9H1K4 315 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC24A3Q9HC58 644 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 COMMD3Q9UBI1 195 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PRSS50Q9UI38 385 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAM30Q9UKF2 790 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ACACAQ13085 2346 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 AIPO00170 330 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ATF1P18846 271 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 MPGP29372 298 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PTGER4P35408 488 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ASPHD2Q6ICH7 369 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 C16orf87Q6PH81 154 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM180AQ6UWF9 173 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 DRAM2Q6UX65 266 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZSR3 168 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM214BQ7L5A3 538 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 DPPA2Q7Z7J5 298 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 OR5M9Q8NGP3 310 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 OR13C3Q8NGS6 347 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 FGFBP3Q8TAT2 258 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SOSTQ9BQB4 213 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 MRI1Q9BV20 369 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 DAPK2Q9UIK4 370 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 TUBD1Q9UJT1 453 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 V9GYH0 126 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0U1RQV5 110 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 IFITM5A6NNB3 132 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 DOK2O60496 412 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 FAPQ12884 760 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC36A2Q495M3 483 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF774Q6NX45 483 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 C9orf106Q8NAJ2 232 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC54Q8NEL0 328 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CMTM3Q96MX0 182 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 BRD7Q9NPI1 651 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF224Q9NZL3 707 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF319Q9P2F9 582 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 DCHS1Q96JQ0 3298 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1B0GVI7 797 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 M0R135 149 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SYT7O43581 403 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 HPGDSO60760 199 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 GABRA1P14867 456 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 EVX1P49640 407 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 TPTEP56180 551 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 GALK2Q01415 458 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 TFAP2EQ6VUC0 442 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM57BQ71RH2 274 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2J2Q8N2K1 259 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PLPP7Q8NBV4 271 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF799Q96GE5 643 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SP140LQ9H930 580 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 MED12LQ86YW9 2145 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFHX4Q86UP3 3567 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 F5H5K5 113 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNHIT1O43257 154 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR1O75083 606 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 COX5BP10606 129 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF12P17014 697 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00303Q3SY05 128 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD16Q6P6B7 361 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 DOK3Q7L591 496 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 Q8NA96 180 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 OR1K1Q8NGR3 316 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 OR6K3Q8NGY3 331 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 AKR7LQ8NHP1 331 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 OR51E1Q8TCB6 317 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PGAM5Q96HS1 289 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 DIRAS2Q96HU8 199 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC32Q9BV29 185 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 C12orf49Q9H741 205 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CKLFQ9UBR5 152 aa19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms