RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583007.2

PKIB-208, Transcript of cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta, human

TSL 5

Gene PKIB, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKIB-208	ENST00000583007	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	CR1	P17927	2039 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	GPR171	O14626	319 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	MRAS	O14807	208 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	FMO6P	O60774	539 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	NPPA	P01160	153 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	RAF1	P04049	648 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	GPI	P06744	558 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	DNASE1	P24855	282 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	OR1E2	P47887	323 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	UGT2B15	P54855	530 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	SELENOW	P63302	87 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	ZP4	Q12836	540 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	GNA13	Q14344	377 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	ULK3	Q6PHR2	472 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	PIGX	Q8TBF5	258 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	DDIT4L	Q96D03	193 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	OXGR1	Q96P68	337 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	OR2M2	Q96R28	347 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	EMC6	Q9BV81	110 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	NOX3	Q9HBY0	568 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	CD300A	Q9UGN4	299 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	RASD1	Q9Y272	281 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.17	□□□□□ -1.74	6e-7	■■■□□ 15
PKIB-208	ENST00000583007	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007		A0A096LNT2	108 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	C5orf58	C9J3I9	102 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	HS3ST1	O14792	307 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	AIM2	O14862	343 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	ANGPT2	O15123	496 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	SLC22A2	O15244	555 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	OR2T1	O43869	369 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	PTP4A3	O75365	173 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	SERPINB7	O75635	380 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	RAD51D	O75771	328 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	VAMP5	O95183	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	ITGA2	P17301	1181 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	GGT1	P19440	569 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	FUT1	P19526	365 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PKIB-208	ENST00000583007	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74

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